113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00470 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00470  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  146  1e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.654472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0040  hypothetical protein  97.18 
 
 
71 aa  143  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.224078  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0104  hypothetical protein  87.32 
 
 
71 aa  129  1e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0101  hypothetical protein  83.1 
 
 
71 aa  125  2e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.74292e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0101  hypothetical protein  81.69 
 
 
71 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0086  hypothetical protein  81.69 
 
 
71 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02080  hypothetical protein  76.06 
 
 
71 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155855  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0100  hypothetical protein  80.28 
 
 
71 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0155  hypothetical protein  78.87 
 
 
71 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.275078  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0037  hypothetical protein  77.46 
 
 
71 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0075  hypothetical protein  74.65 
 
 
71 aa  120  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0923  hypothetical protein  77.46 
 
 
71 aa  118  2e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2873  hypothetical protein  70.42 
 
 
71 aa  113  1e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.272861  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1015  hypothetical protein  67.61 
 
 
71 aa  107  4e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.687737  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2917  protein of unknown function DUF1458  61.54 
 
 
73 aa  92.8  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5579  hypothetical protein  62.5 
 
 
68 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455819  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0546  hypothetical protein  62.5 
 
 
70 aa  91.3  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  64.06 
 
 
70 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3647  hypothetical protein  60.29 
 
 
68 aa  91.3  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3058  hypothetical protein  60.61 
 
 
69 aa  91.3  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0829  hypothetical protein  60.94 
 
 
91 aa  90.1  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0054  protein of unknown function DUF1458  52.94 
 
 
70 aa  89.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2980  hypothetical protein  60.94 
 
 
67 aa  88.6  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2417  hypothetical protein  57.81 
 
 
69 aa  89.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0138053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2075  hypothetical protein  58.82 
 
 
105 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381889  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0035  protein of unknown function DUF1458  56.06 
 
 
71 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150781  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1707  hypothetical protein  61.54 
 
 
70 aa  88.2  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1516  hypothetical protein  60.61 
 
 
68 aa  87.8  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2992  hypothetical protein  59.7 
 
 
69 aa  87.8  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2524  hypothetical protein  60.29 
 
 
84 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2419  hypothetical protein  60.29 
 
 
69 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2377  hypothetical protein  60.29 
 
 
69 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.836659  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0025  hypothetical protein  57.81 
 
 
92 aa  87.4  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00461369  normal  0.188661 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3195  hypothetical protein  60.94 
 
 
70 aa  87.4  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3527  hypothetical protein  57.81 
 
 
70 aa  86.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3625  hypothetical protein  56.06 
 
 
68 aa  86.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1315  hypothetical protein  59.09 
 
 
69 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76957  hitchhiker  0.00854236 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4314  protein of unknown function DUF1458  57.81 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.302415  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4204  protein of unknown function DUF1458  57.81 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202161  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2454  protein of unknown function DUF1458  58.82 
 
 
68 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.803426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2871  hypothetical protein  57.81 
 
 
68 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4069  hypothetical protein  59.38 
 
 
69 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1942  hypothetical protein  57.58 
 
 
68 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00110853  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11529  hypothetical protein  53.52 
 
 
70 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0202  protein of unknown function DUF1458  55.07 
 
 
70 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5265  hypothetical protein  59.09 
 
 
69 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.604284  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3026  protein of unknown function DUF1458  59.7 
 
 
70 aa  84.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0262302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1287  hypothetical protein  58.57 
 
 
69 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  0.643908 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0118  hypothetical protein  54.69 
 
 
70 aa  84  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.813718  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1868  hypothetical protein  57.58 
 
 
69 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1941  hypothetical protein  57.58 
 
 
69 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.453713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1978  hypothetical protein  57.58 
 
 
69 aa  83.2  1e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0375499 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2317  protein of unknown function DUF1458  54.55 
 
 
68 aa  83.2  1e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0934254 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6124  hypothetical protein  57.58 
 
 
69 aa  82.4  2e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1954  hypothetical protein  57.58 
 
 
69 aa  82.4  2e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2575  protein of unknown function DUF1458  54.84 
 
 
70 aa  82  2e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5942  hypothetical protein  50.75 
 
 
70 aa  82  2e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0881826  hitchhiker  0.00766382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1305  hypothetical protein  54.69 
 
 
68 aa  81.6  3e-15  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268431  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0507  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  82  3e-15  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2011  hypothetical protein  57.38 
 
 
73 aa  81.6  3e-15  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1147  hypothetical protein  49.25 
 
 
70 aa  80.5  7e-15  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0963984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0268  hypothetical protein  52.94 
 
 
69 aa  80.5  8e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0188  hypothetical protein  60.61 
 
 
68 aa  80.1  9e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2274  protein of unknown function DUF1458  47.89 
 
 
70 aa  80.1  9e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  8.72393e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3395  protein of unknown function DUF1458  54.41 
 
 
71 aa  79.7  1e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.42441  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2825  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  79.7  1e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390532  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0234  hypothetical protein  46.97 
 
 
68 aa  79.7  1e-14  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.970646  normal  0.774403 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1944  hypothetical protein  49.3 
 
 
71 aa  79  2e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307456  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1966  hypothetical protein  54.84 
 
 
67 aa  79  2e-14  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.653562  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2850  protein of unknown function DUF1458  50 
 
 
68 aa  79.3  2e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0494  protein of unknown function DUF1458  48.53 
 
 
70 aa  79  2e-14  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0732836 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2626  hypothetical protein  59.38 
 
 
69 aa  78.2  3e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.679626  normal  0.799325 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1441  hypothetical protein  56.25 
 
 
70 aa  78.6  3e-14  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.857436  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1416  protein of unknown function DUF1458  50 
 
 
69 aa  77.4  6e-14  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.065081  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3381  protein of unknown function DUF1458  51.56 
 
 
69 aa  77  8e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.54634e-05  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0772  protein of unknown function DUF1458  45.71 
 
 
69 aa  76.6  1e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2570  hypothetical protein  43.66 
 
 
70 aa  75.9  2e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2504  protein of unknown function DUF1458  53.12 
 
 
83 aa  75.9  2e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.512354  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1727  protein of unknown function DUF1458  50 
 
 
70 aa  73.6  8e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3623  protein of unknown function DUF1458  50 
 
 
69 aa  72.4  2e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00675874  normal  0.0186505 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0033  protein of unknown function DUF1458  59.68 
 
 
76 aa  72.4  2e-12  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05065  hypothetical protein  55.22 
 
 
83 aa  72  2e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12548 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1894  hypothetical protein  45.16 
 
 
67 aa  72  2e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1985  protein of unknown function DUF1458  45.16 
 
 
67 aa  72  2e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00566832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2070  protein of unknown function DUF1458  45.16 
 
 
67 aa  72  2e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0718  hypothetical protein  52.31 
 
 
73 aa  70.5  8e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0177  hypothetical protein  50.77 
 
 
72 aa  69.7  1e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0882703  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0896  hypothetical protein  51.61 
 
 
67 aa  68.9  2e-11  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0051  protein of unknown function DUF1458  57.81 
 
 
70 aa  68.6  3e-11  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0927  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  67.4  6e-11  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3012  hypothetical protein  48.44 
 
 
71 aa  67  7e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.86595e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0195  hypothetical protein  47.83 
 
 
72 aa  66.2  1e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3147  hypothetical protein  49.25 
 
 
73 aa  59.3  2e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1232  protein of unknown function DUF1458  41.27 
 
 
74 aa  52  3e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000336605 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4753  hypothetical protein  40 
 
 
46 aa  51.6  3e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.720528  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07040  hypothetical protein  39.68 
 
 
70 aa  50.4  8e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1560  hypothetical protein  38.33 
 
 
113 aa  48.5  3e-05  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1660  protein of unknown function DUF1458  41.27 
 
 
67 aa  47.4  6e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.717949  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2249  hypothetical protein  34.33 
 
 
72 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2636  protein of unknown function DUF1458  35.48 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>