More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0014 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP_Se16SE  16S ribosomal RNA  84.52 
 
 		 1554 bp  745    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SF  16S ribosomal RNA  84.43 
 
 		 1554 bp  737    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  88.12 
 
 		 1612 bp  771    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  88.12 
 
 		 1612 bp  771    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_rRNA16S2  16S ribosomal RNA  82.87 
 
 		 1493 bp  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0081  16S ribosomal RNA  84.71 
 
 		 1562 bp  749    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0022  16S ribosomal RNA  84.54 
 
 		 1587 bp  658    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  88.12 
 
 		 1612 bp  771    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  88.12 
 
 		 1612 bp  771    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  88.12 
 
 		 1612 bp  771    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_rRNA16S1  16S ribosomal RNA  82.87 
 
 		 1493 bp  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SA  16S ribosomal RNA  85.18 
 
 		 1551 bp  785    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SB  16S ribosomal RNA  85.18 
 
 		 1551 bp  785    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SC  16S ribosomal RNA  85.18 
 
 		 1551 bp  785    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SD  16S ribosomal RNA  85.18 
 
 		 1551 bp  785    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SE  16S ribosomal RNA  85.18 
 
 		 1551 bp  785    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SF  16S ribosomal RNA  85.18 
 
 		 1551 bp  785    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SG  16S ribosomal RNA  85.18 
 
 		 1551 bp  785    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0070  16S ribosomal RNA  84.71 
 
 		 1545 bp  749    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0081  16S ribosomal RNA  84.71 
 
 		 1545 bp  749    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.621558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0001  16S ribosomal RNA  86.11 
 
 		 1544 bp  882    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00178674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0008  16S ribosomal RNA  86.11 
 
 		 1544 bp  882    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0015  16S ribosomal RNA  86.11 
 
 		 1544 bp  882    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r01  16S ribosomal RNA  85.74 
 
 		 1555 bp  837    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  85.73 
 
 		 1510 bp  821    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  85.63 
 
 		 1509 bp  815    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 1521 bp  1140    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 1521 bp  1140    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0027  16S ribosomal RNA  86.11 
 
 		 1544 bp  882    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.635376  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0019  16S ribosomal RNA  84.42 
 
 		 1526 bp  904    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0017  16S ribosomal RNA  84.71 
 
 		 1545 bp  749    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00979758  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0046  16S ribosomal RNA  84.43 
 
 		 1587 bp  650    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000560958  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0021  16S ribosomal RNA  84.71 
 
 		 1545 bp  749    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0004  16S ribosomal RNA  84.07 
 
 		 1477 bp  749    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0018  16S ribosomal RNA  84.07 
 
 		 1477 bp  749    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0046  16S ribosomal RNA  84.07 
 
 		 1477 bp  749    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0064  16S ribosomal RNA  84.07 
 
 		 1477 bp  749    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0067  16S ribosomal RNA  84.71 
 
 		 1545 bp  759    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0040  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 		 1512 bp  890    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0048  16S ribosomal RNA  84.24 
 
 		 1512 bp  890    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0055  16S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 1466 bp  696    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831881 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0009  16S ribosomal RNA  84.54 
 
 		 1587 bp  658    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000146343  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0003  16S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 1587 bp  652    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000280659  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0012  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1475 bp  690    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0070  16S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 1475 bp  690    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0013  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 		 1489 bp  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0081  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1587 bp  660    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000506344  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0005  16S ribosomal RNA  84.71 
 
 		 1545 bp  749    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.328307  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0022  16S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 1513 bp  787    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00120724  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2998  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 1522 bp  648    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3001  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 1517 bp  648    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3004  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 1522 bp  648    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3007  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 1522 bp  648    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3010  16S ribosomal RNA  86.7 
 
 		 1522 bp  640    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3013  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 1522 bp  648    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3018  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 1518 bp  648    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3021  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 1518 bp  648    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r01  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 1522 bp  648    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r04  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 1522 bp  648    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r07  16S ribosomal RNA  86.7 
 
 		 1522 bp  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r10  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 1522 bp  648    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r13  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 1522 bp  648    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r16  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 1522 bp  648    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r19  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 1522 bp  648    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r22  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 1522 bp  648    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r26  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 1522 bp  648    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r30  16S ribosomal RNA  86.84 
 
 		 1517 bp  648    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  88.12 
 
 		 1612 bp  771    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  86.38 
 
 		 1521 bp  1132    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  86.46 
 
 		 1521 bp  1140    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0005  16S ribosomal RNA  84.71 
 
 		 1555 bp  749    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.535884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0020  16S ribosomal RNA  84.71 
 
 		 1555 bp  749    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0017  16S ribosomal RNA  84.71 
 
 		 1555 bp  749    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000010305  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r0552  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1548 bp  676    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2179  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1548 bp  676    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2451  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1548 bp  676    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.892819  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2494  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1548 bp  676    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2572  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1548 bp  676    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2609  16S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 1548 bp  676    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0449  16S ribosomal RNA  84.98 
 
 		 1579 bp  789    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.3791 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1566  16S ribosomal RNA  84.98 
 
 		 1579 bp  789    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1585  16S ribosomal RNA  84.98 
 
 		 1579 bp  789    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1620  16S ribosomal RNA  84.98 
 
 		 1579 bp  789    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0929772 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1801  16S ribosomal RNA  84.98 
 
 		 1579 bp  789    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000298169 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1807  16S ribosomal RNA  84.98 
 
 		 1579 bp  789    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000448863 
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0019  16S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 1550 bp  761    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0079  16S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 1550 bp  761    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.940903  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0168  16S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 1550 bp  761    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0181  16S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 1550 bp  761    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0409  16S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 1550 bp  761    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r1784  16S ribosomal RNA  84.59 
 
 		 1550 bp  753    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0016  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1517 bp  775    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.672174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0021  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1517 bp  775    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0029  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1517 bp  775    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0064  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1517 bp  775    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0067  16S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 1517 bp  775    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  88.12 
 
 		 1612 bp  771    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  88.12 
 
 		 1612 bp  771    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0064  16S ribosomal RNA  84.54 
 
 		 1587 bp  658    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000848951  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0067  16S ribosomal RNA  84.71 
 
 		 1562 bp  759    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>