9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0029 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0029  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0061  hypothetical protein  53.47 
 
 
216 aa  220  1e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0816  SNF7 protein  36 
 
 
216 aa  125  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.283391 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1430  conserved hypothetical protein  35.64 
 
 
223 aa  121  1e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1866  conserved hypothetical protein  34.85 
 
 
221 aa  118  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2179  hypothetical protein  34.47 
 
 
211 aa  114  1e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54958  hitchhiker  0.000254205 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1695  Snf7  31.63 
 
 
221 aa  112  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1671  hypothetical protein  26.44 
 
 
270 aa  76.6  3e-13  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000972701  normal  0.698741 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1891  conserved hypothetical protein  24.69 
 
 
259 aa  75.9  5e-13  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.522365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>