34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4587 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4587  ChaB family protein  100 
 
 		 138 aa  282  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0893  hypothetical protein  68.15 
 
 		 134 aa  184  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14450  hypothetical protein  65.22 
 
 		 136 aa  174  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2019  ChaB family protein  60.56 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742631  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2742  ChaB family protein  65.19 
 
 		 131 aa  170  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.764397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5498  hypothetical protein  68 
 
 		 130 aa  167  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00390859  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1756  hypothetical protein  62.22 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721453  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1742  hypothetical protein  59.26 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198279  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3007  ChaB family protein  60.9 
 
 		 141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000471912  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1804  hypothetical protein  61.6 
 
 		 133 aa  147  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3411  hypothetical protein  57.25 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3652  ChaB  56.82 
 
 		 139 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3725  ChaB family protein  56.82 
 
 		 139 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0871  ChaB family protein  58.02 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0793  ChaB family protein  56.49 
 
 		 139 aa  143  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3665  ChaB family protein  54.81 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02480  ChaB protein  59.4 
 
 		 141 aa  140  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4490  ChaB family protein  55.97 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1538  hypothetical protein  59.54 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.213562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0379  ChaB family protein  46.58 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.303727  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0461  putative cation transport regulato, ChaB  38.16 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2785  ChaB  39.39 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.167104  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3369  hypothetical protein  63.33 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13248  hypothetical protein  60 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0646  hypothetical protein  55.26 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2443  ChaB  39.44 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01038  hypothetical protein  53.33 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0473132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5375  hypothetical protein  56.67 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0349  ChaB  39.71 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108518 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2071  ChaB  37.84 
 
 		 74 aa  42  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2331  cation transport regulator  37.5 
 
 		 76 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1848  ChaB family protein  40.28 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23330  hypothetical protein  38.24 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0020  ChaB family protein  42.11 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>