158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1185 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1185  BolA family protein  100 
 
 		 77 aa  158  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.234576 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3118  BolA family protein  75.32 
 
 		 77 aa  124  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1594  BolA-like protein  55.26 
 
 		 78 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1506  BolA family protein  57.14 
 
 		 77 aa  97.1  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935248  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0006  BolA family protein  54.55 
 
 		 78 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0009  BolA family protein  54.55 
 
 		 78 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3710  BolA-like protein  54.55 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1755  BolA-like protein  54.55 
 
 		 78 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1309  BolA-like protein  53.25 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1276  BolA-like protein  54.55 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2145  BolA family protein  54.55 
 
 		 77 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230515  normal  0.346751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1789  BolA family protein  54.55 
 
 		 78 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1126  BolA family protein  53.25 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1637  BolA-like protein  54.55 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1023  BolA family protein  59.21 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15015  normal  0.871114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2520  BolA-like protein  51.95 
 
 		 77 aa  94  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269004  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1935  BolA family protein  54.55 
 
 		 77 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0012  BolA family protein  53.25 
 
 		 78 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0013  BolA family protein  53.25 
 
 		 78 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0874253  normal  0.885333 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0011  BolA family protein  51.95 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5884  hypothetical protein  55.84 
 
 		 77 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206517  normal  0.559405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4089  BolA family protein  56.58 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2585  BolA family protein  54.55 
 
 		 78 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6655  normal  0.361888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4711  BolA family protein  51.32 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2390  BolA family protein  51.95 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1939  BolA/YrbA family protein  53.25 
 
 		 78 aa  90.9  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0836  bolA-related protein  51.95 
 
 		 77 aa  90.5  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0828  bolA-related protein  51.95 
 
 		 77 aa  90.5  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.775984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0124  BolA family protein  51.95 
 
 		 77 aa  90.5  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2666  BolA family protein  50.65 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.306779  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5397  hypothetical protein  52.63 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0707  BolA-like protein  54.55 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0186  BolA family protein  48.05 
 
 		 78 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.49621  normal  0.367892 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0864  BolA family protein  50 
 
 		 77 aa  84.3  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0356  BolA-like protein  45.45 
 
 		 77 aa  80.1  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.649032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3464  BolA family protein  50 
 
 		 78 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0263  BolA family protein  45.95 
 
 		 80 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0466064  normal  0.451976 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1391  BolA family protein  47.5 
 
 		 80 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.45441  normal  0.295987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0893  BolA family protein  48.1 
 
 		 80 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0866848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  44.74 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_002978  WD0490  hypothetical protein  47.3 
 
 		 72 aa  71.6  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.529866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1597  BolA family protein  44.3 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0816624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2952  BolA-like protein  44.3 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0590  BolA-like protein  43.24 
 
 		 80 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0303  BolA family protein  41.1 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.321518  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02233  BolA superfamily transcriptional regulator  44.74 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0700  BolA-like protein  41.1 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.088559  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  43.66 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  43.66 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2783  BolA family protein  41.89 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2172  BolA-like protein  43.75 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5266  BolA family protein  45.07 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  43.42 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1660  BolA family protein  40 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1417  BolA family protein  36.84 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.415851  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1146  hypothetical protein  42.47 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10771  BolA-like protein  39.47 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.42913 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1117  BolA-like protein  43.9 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  42.67 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3037  BolA family protein  44 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  44 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0202  BolA family protein  35.44 
 
 		 86 aa  60.1  0.000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00942282  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  43.06 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1822  BolA family protein  43.42 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  42.47 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  41.67 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  41.67 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1712  hypothetical protein  41.77 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0676  BolA family protein  41.33 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3114  BolA-like protein  43.06 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3251  BolA-like protein  43.06 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0960  BolA family protein  41.33 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279652 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0204  BolA family protein  38.16 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0507648  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2203  BolA family protein  37.8 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.727239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  42.47 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  44 
 
 		 82 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  44 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3598  BolA family protein  40.79 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00692216  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  38.67 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0640  BolA-like protein  40.85 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0762  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2762  BolA family protein  40.28 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14721  BolA-like protein  40.85 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0966227  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  41.1 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  40 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2742  BolA-like protein  48.28 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0506  BolA family protein  41.33 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  34.67 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09531  BolA-like protein  32.89 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.336163 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2781  BolA-like protein  33.78 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.158221  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3520  BolA-like protein  40.28 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  51.92 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2685  BolA-like protein  40.28 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0340  BolA family protein  40.28 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0422  BolA family protein  40.28 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  51.92 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12011  BolA-like protein  38.89 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  40 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2050  BolA family protein  36.84 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0401  BolA family protein  40.28 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655562 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>