37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0044 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0044  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 
347 aa  674    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3555  flagellar hook-associated protein FlgL  46.08 
 
 
348 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1113  flagellar hook-associated protein FlgL  41.62 
 
 
347 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.406024  normal  0.67515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6508  flagellar hook-associated protein FlgL  41.21 
 
 
344 aa  232  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1137  flagellar hook-associated protein FlgL  37.9 
 
 
348 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512733  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1042  flagellar hook-associated protein FlgL  37.9 
 
 
351 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4191  flagellar hook-associated protein FlgL  38.78 
 
 
348 aa  226  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8937  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0685  flagellar hook-associated protein FlgL  37.1 
 
 
350 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0281521  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0766  flagellar hook-associated protein FlgL  36.11 
 
 
355 aa  216  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0696  flagellar hook-associated protein FlgL  36.68 
 
 
350 aa  215  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  35.84 
 
 
349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0659  flagellar hook-associated protein FlgL  36.31 
 
 
350 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1705  flagellar hook-associated protein FlgL  34.29 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.173366 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0278  flagellar hook-associated protein FlgL  32.66 
 
 
350 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0340  flagellar hook-associated protein FlgL  31.91 
 
 
350 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112309  normal  0.583206 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1120  flagellar hook-associated protein FlgL  30.81 
 
 
360 aa  159  9e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0372  flagellar hook-associated protein FlgL  30.2 
 
 
350 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5529  flagellar hook-associated protein FlgL  32.39 
 
 
348 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0173454 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5249  flagellar hook-associated protein FlgL  30.68 
 
 
348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2698  putative flagellar hook-associated protein  25.92 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3377  flagellar hook-associated protein FlgL  23.65 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  27.68 
 
 
497 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.337624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2015  hypothetical protein  38.81 
 
 
587 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0891  hypothetical protein  27.78 
 
 
597 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0952  hypothetical protein  33.33 
 
 
597 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0111179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0915  hypothetical protein  33.33 
 
 
597 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342242  normal  0.94369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3479  flagellar hook-associated protein FlgL  24.21 
 
 
358 aa  47  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.927973  normal  0.0673338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1487  hypothetical protein  39.24 
 
 
525 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5545  hypothetical protein  29.47 
 
 
532 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1333  hypothetical protein  27.22 
 
 
587 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367771  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1305  putative flagellar hook-associated protein  25.86 
 
 
333 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4453  hypothetical protein  40 
 
 
535 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3815  hypothetical protein  42.86 
 
 
535 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.108699  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1101  hypothetical protein  30.4 
 
 
501 aa  43.9  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.322758 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2965  putative flagellar hook-associated protein  25.86 
 
 
333 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3169  flagellar hook-associated protein FlgL  21.78 
 
 
302 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.247991 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2738  hypothetical protein  28.26 
 
 
333 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>