34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0032 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0032  DNA-directed RNA polymerase subunit H  100 
 
 		 83 aa  166  8e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.256888  normal  0.101872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1205  RNA polymerase Rpb5  72.84 
 
 		 84 aa  131  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0224955  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0287  DNA-directed RNA polymerase subunit H  48.72 
 
 		 80 aa  83.2  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1855  RNA polymerase Rpb5  50.7 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0704  DNA-directed RNA polymerase subunit H  61.02 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00554556 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2320  DNA-directed RNA polymerase subunit H  58.73 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.646201  hitchhiker  0.000103399 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2090  DNA-directed RNA polymerase subunit H  52.86 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0346  RNA polymerase Rpb5  50 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1180  DNA-directed RNA polymerase subunit H  43.48 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0026  DNA-directed RNA polymerase subunit H  47.14 
 
 		 78 aa  67  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0350925  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1962  DNA-directed RNA polymerase subunit H  60.87 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0792  DNA-directed RNA polymerase subunit H  47.89 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0670  DNA-directed RNA polymerase subunit H  46.58 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0605  DNA-directed RNA polymerase subunit H  41.67 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0218  DNA-directed RNA polymerase subunit H  41.67 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.669436  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1313  DNA-directed RNA polymerase subunit H  41.67 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00752  RNA polymerase subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G14110)  44.93 
 
 		 235 aa  61.2  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.92156 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1935  DNA-directed RNA polymerase subunit H  38.96 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3695  DNA-directed RNA polymerase subunit H  44.93 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.534193 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1164  DNA-directed RNA polymerase subunit H  35.71 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29622 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0049  DNA-directed RNA polymerase subunit H  40.58 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.536679 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25420  predicted protein  37.18 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.766556  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0108  DNA-directed RNA polymerase subunit H  45.33 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.44592 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0350  RNA polymerase Rpb5  42.67 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2158  DNA-directed RNA polymerase subunit H  36.36 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.833639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36865  predicted protein  37.68 
 
 		 205 aa  51.6  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00020104  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53602  DNA-directed RNA polymerases II 24 kDa polypeptide (RNA polymerase II subunit 5)  40.91 
 
 		 213 aa  52  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000357344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07710  DNA-directed RNA polymerases ii 24 kda polypeptide, putative  35.21 
 
 		 221 aa  51.6  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2149  RNA polymerase Rpb5  41.33 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0516  RNA polymerase Rpb5  40 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0311  DNA-directed RNA polymerase subunit H  33.78 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0297  DNA-directed RNA polymerase subunit H  33.78 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0785  DNA-directed RNA polymerase subunit H  41.33 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1092  RNA polymerase Rpb5  44.59 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00025916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>