28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0033 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0033  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00113494  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5347  hypothetical protein  38.89 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0724  hypothetical protein  32.84 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15621  hypothetical protein  32.84 
 
 
85 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.843222  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1609  hypothetical protein  39.62 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2108  hypothetical protein  42.31 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4463  hypothetical protein  28.99 
 
 
84 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991028  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07510  hypothetical protein  29.41 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04761  hypothetical protein  28.36 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.109764  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0869  hypothetical protein  29.85 
 
 
83 aa  51.6  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2906  hypothetical protein  33.93 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000808299 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0454  hypothetical protein  31.88 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.363875  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04861  hypothetical protein  26.87 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04451  hypothetical protein  28.36 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0750261  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06893  hypothetical protein  33.93 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1716  hypothetical protein  33.96 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0421  hypothetical protein  32.08 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3743  hypothetical protein  28.57 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2565  hypothetical protein  33.93 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2352  hypothetical protein  32.14 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182131 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1995  hypothetical protein  33.93 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1266  hypothetical protein  32.79 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.212211 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1058  hypothetical protein  30.77 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1384  hypothetical protein  29.03 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7363  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03929  hypothetical protein  32.26 
 
 
94 aa  47  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3692  hypothetical protein  37.25 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.647054  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1788  hypothetical protein  30.19 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.532232  normal  0.309695 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1305  hypothetical protein  34.62 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.773936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>