45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2332 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2332  cobalt transport protein CbiN  100 
 
 
101 aa  202  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3206  cobalt transport protein CbiN  51.28 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2146  cobalt transport protein CbiN  42.42 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217949  normal  0.496268 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0579  cobalt transport protein CbiN  41.49 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1217  cobalt transport protein CbiN  36.56 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0928  cobalt transport protein  41.84 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.195338  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0530  cobalt transport protein CbiN  35.92 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1294  cobalt transport protein CbiN  37.11 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00272404  normal  0.0249047 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0183  cobalt transport protein CbiN  39.58 
 
 
103 aa  58.2  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0186  cobalt transport protein CbiN  39.58 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.51838  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1703  Cobalt transport protein CbiN  33.66 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.66307  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0145  cobalt transport protein CbiN  47.46 
 
 
100 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00778017  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0791  cobalt transport protein CbiN  43.06 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0096  cobalt transport protein CbiN  38.46 
 
 
97 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1192  cobalt transport protein CbiN  38.82 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2732  cobalt transport protein CbiN  38.81 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.701075  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0726  cobalt transport protein CbiN  40 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.685359  normal  0.216079 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1004  Cobalt transport protein CbiN  31.31 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0713  cobalt transport protein  38.24 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2191  cobalt transport protein CbiN  35.11 
 
 
93 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.475152  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2144  cobalt transport protein CbiN  35.11 
 
 
93 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2357  cobalt transport protein CbiN  35.11 
 
 
93 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.22776 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2244  cobalt transport protein CbiN  35.11 
 
 
93 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.123156 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2198  cobalt transport protein CbiN  36.17 
 
 
93 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1221  cobalt transport protein CbiN  37.66 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0324  cobalt transport protein  42.62 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0241813  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1225  cobalt transport protein CbiN  48.39 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4720  cobalt transport protein  41.33 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2602  cobalt transport protein  41.79 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1084  hypothetical protein  32.91 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3735  Cobalt transport protein CbiN  34.72 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103342  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1758  cobalt transport protein CbiN  36.76 
 
 
100 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1061  cobalt transport protein CbiN  42.03 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.019585  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1708  cobalt transport protein CbiN  33 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1699  cobalt transport binding protein  32.32 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000732427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3590  Cobalt transport protein CbiN  33.71 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1267  cobalt transport protein  42.62 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1240  cobalt transport protein CbiN  44.44 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.258486  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1860  cobalt transport protein  32.95 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1386  cobalt transport protein CbiN  30.77 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3821  cobalt transport protein  35.29 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0561  cobalt transport protein  37.88 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2792  cobalt transport protein CbiN  37.1 
 
 
105 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180133  decreased coverage  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3659  cobalt transport protein CbiN  35.42 
 
 
110 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.999431  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2594  cobalt transport protein CbiN  38.57 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.197619  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>