49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1294 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1294  cobalt transport protein CbiN  100 
 
 
102 aa  206  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00272404  normal  0.0249047 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1703  Cobalt transport protein CbiN  50.51 
 
 
108 aa  104  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.66307  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1217  cobalt transport protein CbiN  48.96 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0530  cobalt transport protein CbiN  41.24 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0579  cobalt transport protein CbiN  48.94 
 
 
94 aa  89.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2146  cobalt transport protein CbiN  43.96 
 
 
111 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217949  normal  0.496268 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1084  hypothetical protein  43.9 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0726  cobalt transport protein CbiN  38.89 
 
 
97 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.685359  normal  0.216079 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1192  cobalt transport protein CbiN  38.89 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1708  cobalt transport protein CbiN  36.84 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0096  cobalt transport protein CbiN  37.78 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1699  cobalt transport binding protein  39.18 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000732427  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0713  cobalt transport protein  49.21 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1061  cobalt transport protein CbiN  48.57 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.019585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2732  cobalt transport protein CbiN  44.93 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.701075  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0791  cobalt transport protein CbiN  42.86 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2191  cobalt transport protein CbiN  35.79 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.475152  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2144  cobalt transport protein CbiN  35.79 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2244  cobalt transport protein CbiN  35.79 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.123156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1758  cobalt transport protein CbiN  44.05 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2357  cobalt transport protein CbiN  35.79 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.22776 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2198  cobalt transport protein CbiN  35.79 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1221  cobalt transport protein CbiN  39.47 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0145  cobalt transport protein CbiN  35.56 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00778017  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0183  cobalt transport protein CbiN  34.34 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0186  cobalt transport protein CbiN  34.34 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.51838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2619  cobalt transport protein CbiN  49.21 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3735  Cobalt transport protein CbiN  45.16 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103342  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0324  cobalt transport protein  39.71 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0241813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0561  cobalt transport protein  48.44 
 
 
98 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0928  cobalt transport protein  34.78 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.195338  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1004  Cobalt transport protein CbiN  32.29 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3821  cobalt transport protein  32.32 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1275  Cobalt transport protein CbiN  56.25 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4720  cobalt transport protein  58.14 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1860  cobalt transport protein  37.04 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3590  Cobalt transport protein CbiN  34.04 
 
 
118 aa  57.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2602  cobalt transport protein  54.76 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2594  cobalt transport protein CbiN  48.98 
 
 
103 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.197619  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3206  cobalt transport protein CbiN  44.16 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2792  cobalt transport protein CbiN  44.9 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180133  decreased coverage  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1225  cobalt transport protein CbiN  49.06 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3659  cobalt transport protein CbiN  30.77 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.999431  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1696  cobalt transport protein CbiN  45.28 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.292366 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1386  cobalt transport protein CbiN  33.01 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1240  cobalt transport protein CbiN  50 
 
 
108 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.258486  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1546  cobalt transport protein CbiN  35.23 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000366072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1267  cobalt transport protein  39.66 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2332  cobalt transport protein CbiN  37.11 
 
 
101 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>