48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1225 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1225  cobalt transport protein CbiN  100 
 
 
108 aa  216  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1240  cobalt transport protein CbiN  83.33 
 
 
108 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.258486  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3659  cobalt transport protein CbiN  63.21 
 
 
110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.999431  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1696  cobalt transport protein CbiN  62.62 
 
 
116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.292366 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1860  cobalt transport protein  50 
 
 
96 aa  90.1  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0928  cobalt transport protein  51.06 
 
 
90 aa  89.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.195338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0186  cobalt transport protein CbiN  50 
 
 
103 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.51838  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0183  cobalt transport protein CbiN  50 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1758  cobalt transport protein CbiN  49 
 
 
100 aa  87.8  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0324  cobalt transport protein  60 
 
 
97 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0241813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2357  cobalt transport protein CbiN  47 
 
 
93 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.22776 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2144  cobalt transport protein CbiN  47 
 
 
93 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2191  cobalt transport protein CbiN  47 
 
 
93 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.475152  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2244  cobalt transport protein CbiN  47 
 
 
93 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.123156 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1004  Cobalt transport protein CbiN  47.92 
 
 
95 aa  82.8  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4720  cobalt transport protein  58.33 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2198  cobalt transport protein CbiN  47 
 
 
93 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0096  cobalt transport protein CbiN  41.58 
 
 
97 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1061  cobalt transport protein CbiN  57.97 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.019585  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1192  cobalt transport protein CbiN  43.75 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1221  cobalt transport protein CbiN  50 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0726  cobalt transport protein CbiN  43.75 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.685359  normal  0.216079 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1267  cobalt transport protein  69.09 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2792  cobalt transport protein CbiN  54.29 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180133  decreased coverage  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0713  cobalt transport protein  55.41 
 
 
93 aa  77  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1708  cobalt transport protein CbiN  37.25 
 
 
103 aa  77  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0791  cobalt transport protein CbiN  52.24 
 
 
99 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0561  cobalt transport protein  57.81 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2619  cobalt transport protein CbiN  42.86 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2594  cobalt transport protein CbiN  52.94 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.197619  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3735  Cobalt transport protein CbiN  60 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103342  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3821  cobalt transport protein  43.01 
 
 
98 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2602  cobalt transport protein  56.45 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2732  cobalt transport protein CbiN  56.36 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.701075  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2146  cobalt transport protein CbiN  46.81 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217949  normal  0.496268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3590  Cobalt transport protein CbiN  41.58 
 
 
118 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0145  cobalt transport protein CbiN  44.55 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00778017  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1386  cobalt transport protein CbiN  34.82 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1217  cobalt transport protein CbiN  42.25 
 
 
105 aa  62  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1084  hypothetical protein  46.48 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1275  Cobalt transport protein CbiN  56.72 
 
 
99 aa  60.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0530  cobalt transport protein CbiN  45.74 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0579  cobalt transport protein CbiN  57.41 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1699  cobalt transport binding protein  39.78 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000732427  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1703  Cobalt transport protein CbiN  37.62 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.66307  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1546  cobalt transport protein CbiN  37.5 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000366072  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1294  cobalt transport protein CbiN  49.06 
 
 
102 aa  53.9  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00272404  normal  0.0249047 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2332  cobalt transport protein CbiN  36.46 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>