48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1240 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1240  cobalt transport protein CbiN  100 
 
 
108 aa  216  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.258486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1225  cobalt transport protein CbiN  83.33 
 
 
108 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3659  cobalt transport protein CbiN  65.09 
 
 
110 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.999431  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1696  cobalt transport protein CbiN  61.68 
 
 
116 aa  110  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.292366 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1860  cobalt transport protein  43.88 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0186  cobalt transport protein CbiN  41.18 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.51838  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0183  cobalt transport protein CbiN  41.18 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0713  cobalt transport protein  62.12 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0928  cobalt transport protein  45.83 
 
 
90 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.195338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1758  cobalt transport protein CbiN  45 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0096  cobalt transport protein CbiN  39.6 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0324  cobalt transport protein  52.31 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0241813  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1004  Cobalt transport protein CbiN  44.79 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2191  cobalt transport protein CbiN  45 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.475152  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2144  cobalt transport protein CbiN  45 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2357  cobalt transport protein CbiN  45 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.22776 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2244  cobalt transport protein CbiN  45 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.123156 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2198  cobalt transport protein CbiN  45 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1192  cobalt transport protein CbiN  39.6 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4720  cobalt transport protein  55.88 
 
 
114 aa  73.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0726  cobalt transport protein CbiN  41.67 
 
 
97 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.685359  normal  0.216079 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1267  cobalt transport protein  63.64 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0791  cobalt transport protein CbiN  49.25 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1708  cobalt transport protein CbiN  35.29 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2602  cobalt transport protein  56.45 
 
 
103 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1061  cobalt transport protein CbiN  60 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.019585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1221  cobalt transport protein CbiN  45.1 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3735  Cobalt transport protein CbiN  47.69 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103342  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3821  cobalt transport protein  38 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2792  cobalt transport protein CbiN  48.57 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180133  decreased coverage  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2594  cobalt transport protein CbiN  47.06 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.197619  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2732  cobalt transport protein CbiN  52.73 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.701075  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2146  cobalt transport protein CbiN  38.46 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217949  normal  0.496268 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0561  cobalt transport protein  54.55 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2619  cobalt transport protein CbiN  36.67 
 
 
97 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0530  cobalt transport protein CbiN  44.68 
 
 
99 aa  60.5  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0145  cobalt transport protein CbiN  40.78 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00778017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3590  Cobalt transport protein CbiN  39.6 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1386  cobalt transport protein CbiN  34.91 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1217  cobalt transport protein CbiN  40.85 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1699  cobalt transport binding protein  38.71 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000732427  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0579  cobalt transport protein CbiN  38.64 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1546  cobalt transport protein CbiN  36.25 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000366072  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1275  Cobalt transport protein CbiN  52.08 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1084  hypothetical protein  40.85 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1294  cobalt transport protein CbiN  43.4 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00272404  normal  0.0249047 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1703  Cobalt transport protein CbiN  30.39 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.66307  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2332  cobalt transport protein CbiN  35.05 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>