42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2149 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2149  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  100 
 
 		 440 aa  896    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1445  LOR/SDH bifunctional protein  72.46 
 
 		 409 aa  600  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1408  LOR/SDH bifunctional protein  72.21 
 
 		 411 aa  596  1e-169  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000543179  normal  0.449844 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0938  hypothetical protein  65.51 
 
 		 409 aa  558  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.182607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1342  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  59.01 
 
 		 408 aa  490  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0795325  normal  0.948696 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0686  hypothetical protein  60.55 
 
 		 409 aa  489  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0299  LOR/SDH bifunctional protein  59.55 
 
 		 410 aa  475  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1454  LOR/SDH bifunctional protein  55.67 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0845  LOR/SDH bifunctional protein  54.32 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0372  LOR/SDH bifunctional protein  56.17 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216176  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0465  LOR/SDH bifunctional protein  55.92 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0533  LOR/SDH bifunctional protein  56.03 
 
 		 415 aa  458  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.990735  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1684  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  53.56 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0305327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2692  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  54.13 
 
 		 410 aa  422  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1005  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  52.17 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.538878  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0863  LOR/SDH bifunctional protein  50.62 
 
 		 407 aa  409  1e-113  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00957303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3107  LOR/SDH bifunctional protein  48.31 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0636  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  47.65 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2163  hypothetical protein  49.38 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106153  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  46.57 
 
 		 705 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  46.57 
 
 		 705 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4864  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  47.94 
 
 		 412 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0701737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  45.02 
 
 		 703 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  45.02 
 
 		 703 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  43.51 
 
 		 705 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  45.95 
 
 		 704 aa  356  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  43.84 
 
 		 703 aa  354  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3091  LOR/SDH bifunctional enzyme region  41.4 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1826  LOR/SDH bifunctional protein  41.16 
 
 		 411 aa  322  8e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.263588  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1451  hypothetical protein  34.93 
 
 		 372 aa  194  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.553711  normal  0.492787 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05900  hypothetical protein  35.86 
 
 		 363 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.598804 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2488  hypothetical protein  36.81 
 
 		 363 aa  186  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.492113  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0554  hypothetical protein  36.17 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0121  hypothetical protein  33.33 
 
 		 420 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1885  hypothetical protein  34.78 
 
 		 369 aa  169  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2787  hypothetical protein  36.36 
 
 		 364 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2325  hypothetical protein  34.9 
 
 		 369 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2463  hypothetical protein  40.08 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4880  hypothetical protein  31.85 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0048  hypothetical protein  33.43 
 
 		 365 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0026  hypothetical protein  28.08 
 
 		 367 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0025  hypothetical protein  28.86 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>