33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6181 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6181  hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  925    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173212  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4522  hypothetical protein  53.42 
 
 
559 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2757  hypothetical protein  53.42 
 
 
559 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2755  hypothetical protein  53.42 
 
 
559 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2480  hypothetical protein  53.42 
 
 
559 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465258  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5012  hypothetical protein  67.78 
 
 
414 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5046  hypothetical protein  68.71 
 
 
337 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0495  Y4jO-like protein  53.48 
 
 
319 aa  326  7e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1210  hypothetical protein  32.75 
 
 
548 aa  189  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4191  hypothetical protein  32.89 
 
 
548 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00328451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5578  hypothetical protein  55.56 
 
 
176 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0004  hypothetical protein  31.15 
 
 
282 aa  96.7  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000224703  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2913  hypothetical protein  29.05 
 
 
258 aa  61.6  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3697  hypothetical protein  37.21 
 
 
97 aa  54.3  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321698  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1414  transposase IS66  29.65 
 
 
448 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.764457  normal  0.239155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1877  transposase IS66  29.65 
 
 
448 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1372  transposase IS66  29.65 
 
 
448 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0266  transposase IS66  29.65 
 
 
448 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2819  transposase IS66  29.65 
 
 
448 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2379  transposase IS66  29.65 
 
 
448 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.651042  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1519  transposase IS66  34.15 
 
 
506 aa  50.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292067  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2819  transposase IS66  34.15 
 
 
506 aa  50.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2586  transposase IS66  30.77 
 
 
424 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0251  transposase IS66  34.21 
 
 
490 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0124  transposase IS66  34.21 
 
 
490 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0300  transposase IS66  34.21 
 
 
490 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0187  transposase IS66  34.21 
 
 
490 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.460976  hitchhiker  0.00443516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1381  transposase IS66  34.21 
 
 
490 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590129  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2098  transposase IS66  34.21 
 
 
490 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2977  transposase IS66  34.21 
 
 
490 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.743776  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4126  transposase IS66  34.21 
 
 
490 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4566  transposase IS66  34.21 
 
 
490 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00362  transposase  27.17 
 
 
525 aa  43.5  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>