35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0012 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0012  putative septation inhibitor protein  100 
 
 
94 aa  187  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0020  putative septation inhibitor protein  100 
 
 
94 aa  187  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0181383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0012  putative septation inhibitor protein  100 
 
 
94 aa  187  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.395634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0815  putative septation inhibitor protein  85.11 
 
 
93 aa  160  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144897  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0019  putative septation inhibitor protein  82.98 
 
 
93 aa  155  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.860021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10011  putative septation inhibitor protein  81.91 
 
 
93 aa  153  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0025  protein of unknown function UPF0233  63.27 
 
 
97 aa  108  2e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.389435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0023  protein of unknown function UPF0233  60.42 
 
 
96 aa  100  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245647  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0016  putative septation inhibitor protein  51.04 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00290  putative septation inhibitor protein  56.84 
 
 
87 aa  72.8  2e-12  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348658  normal  0.0596427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0032  protein of unknown function UPF0233  41.24 
 
 
90 aa  71.6  4e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0021  protein of unknown function UPF0233  38.3 
 
 
81 aa  65.5  2e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0059  protein of unknown function UPF0233  42.55 
 
 
85 aa  63.5  8e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0043  putative septation inhibitor protein  37.89 
 
 
84 aa  63.2  1e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0071  protein of unknown function UPF0233  38.24 
 
 
95 aa  61.6  3e-09  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0013  protein of unknown function UPF0233  38.38 
 
 
94 aa  57.8  6e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0020  protein of unknown function UPF0233  36.17 
 
 
83 aa  57  8e-08  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0016  hypothetical protein  36.17 
 
 
84 aa  54.7  4e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269792  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1387  putative septation inhibitor protein  38.46 
 
 
158 aa  53.9  7e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  1.80482e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0058  hypothetical protein  38.54 
 
 
87 aa  53.5  9e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0131  hypothetical protein  32.63 
 
 
88 aa  53.5  9e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120533  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0107  hypothetical protein  35.11 
 
 
81 aa  53.1  1e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0057  hypothetical protein  36.17 
 
 
81 aa  53.1  1e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517765  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0016  protein of unknown function UPF0233  34.74 
 
 
83 aa  52  3e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13441e-11 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0053  hypothetical protein  38.14 
 
 
101 aa  51.2  5e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282222  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0027  putative septation inhibitor protein  40.91 
 
 
130 aa  50.8  6e-06  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0166  protein of unknown function UPF0233  33.33 
 
 
87 aa  49.3  2e-05  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6132  hypothetical protein  37.11 
 
 
87 aa  49.3  2e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5245  protein of unknown function UPF0233  27.66 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0646831  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0014  putative septation inhibitor protein  32.98 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00730  hypothetical protein  27.84 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1372  hypothetical protein  40.3 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.803536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4439  hypothetical protein  30.85 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105645  normal  0.316052 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00150  Uncharacteriszd protein family (UPF0233)  28.42 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28114  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0025  protein of unknown function UPF0233  34.83 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.154771  normal  0.108685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>