50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0096 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0096  cobalt transport protein CbiN  100 
 
 
97 aa  191  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1192  cobalt transport protein CbiN  96.91 
 
 
97 aa  188  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0726  cobalt transport protein CbiN  95.88 
 
 
97 aa  187  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.685359  normal  0.216079 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0791  cobalt transport protein CbiN  84.85 
 
 
99 aa  155  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0145  cobalt transport protein CbiN  70 
 
 
100 aa  137  5e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00778017  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1860  cobalt transport protein  56.18 
 
 
96 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1699  cobalt transport binding protein  51.65 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  7.32427e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3659  cobalt transport protein CbiN  47.96 
 
 
110 aa  90.1  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.999431  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0530  cobalt transport protein CbiN  56.63 
 
 
99 aa  89.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1758  cobalt transport protein CbiN  51.65 
 
 
100 aa  88.2  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0928  cobalt transport protein  49.46 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.195338  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0713  cobalt transport protein  68.33 
 
 
93 aa  88.2  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2146  cobalt transport protein CbiN  52.53 
 
 
111 aa  87  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217949  normal  0.496268 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1061  cobalt transport protein CbiN  58.73 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.019585  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0183  cobalt transport protein CbiN  48.89 
 
 
103 aa  84.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4720  cobalt transport protein  58.9 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3821  cobalt transport protein  51.04 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0186  cobalt transport protein CbiN  48.89 
 
 
103 aa  84.3  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.51838  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1004  Cobalt transport protein CbiN  48.42 
 
 
95 aa  84.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2198  cobalt transport protein CbiN  44.21 
 
 
93 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2244  cobalt transport protein CbiN  44.21 
 
 
93 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.123156 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2191  cobalt transport protein CbiN  44.21 
 
 
93 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.475152  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2144  cobalt transport protein CbiN  44.21 
 
 
93 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2357  cobalt transport protein CbiN  44.21 
 
 
93 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.22776 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1084  hypothetical protein  55.84 
 
 
104 aa  82.8  1e-15  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1221  cobalt transport protein CbiN  53.85 
 
 
95 aa  83.2  1e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1217  cobalt transport protein CbiN  44.57 
 
 
105 aa  82  2e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0324  cobalt transport protein  67.24 
 
 
97 aa  82.8  2e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0241813  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2792  cobalt transport protein CbiN  50.68 
 
 
105 aa  80.1  8e-15  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180133  decreased coverage  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3590  Cobalt transport protein CbiN  44.71 
 
 
118 aa  80.5  8e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1696  cobalt transport protein CbiN  60.29 
 
 
116 aa  80.1  9e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.292366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2602  cobalt transport protein  63.33 
 
 
103 aa  79  2e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2732  cobalt transport protein CbiN  56.45 
 
 
108 aa  78.6  3e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.701075  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2594  cobalt transport protein CbiN  50.7 
 
 
103 aa  78.2  4e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.197619  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0561  cobalt transport protein  55.38 
 
 
98 aa  77.4  6e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1703  Cobalt transport protein CbiN  43.48 
 
 
108 aa  77  7e-14  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.66307  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3735  Cobalt transport protein CbiN  52.31 
 
 
104 aa  76.6  1e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103342  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0579  cobalt transport protein CbiN  47.37 
 
 
94 aa  76.3  1e-13  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1225  cobalt transport protein CbiN  63.16 
 
 
108 aa  75.5  2e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1267  cobalt transport protein  62.5 
 
 
97 aa  74.7  4e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1708  cobalt transport protein CbiN  36.56 
 
 
103 aa  71.2  4e-12  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1240  cobalt transport protein CbiN  54.84 
 
 
108 aa  71.2  4e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.258486  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1294  cobalt transport protein CbiN  37.78 
 
 
102 aa  70.9  6e-12  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00272404  normal  0.0249047 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2619  cobalt transport protein CbiN  50.77 
 
 
97 aa  70.1  9e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1275  Cobalt transport protein CbiN  58.46 
 
 
99 aa  67  8e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1546  cobalt transport protein CbiN  40.28 
 
 
94 aa  63.2  1e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.66072e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1386  cobalt transport protein CbiN  34.62 
 
 
110 aa  56.6  1e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3206  cobalt transport protein CbiN  37.5 
 
 
100 aa  52  3e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2332  cobalt transport protein CbiN  39.24 
 
 
101 aa  43.5  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0542  Cobalt transport protein CbiN  50 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>