19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1049 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1049  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  483  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.931099  normal  0.654081 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0332  hypothetical protein  39.83 
 
 
278 aa  177  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2481  hypothetical protein  40.17 
 
 
274 aa  176  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2260  hypothetical protein  39.66 
 
 
279 aa  176  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.087732 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0407  hypothetical protein  39.04 
 
 
279 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1649  hypothetical protein  34.22 
 
 
274 aa  106  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140534  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0039  hypothetical protein  35.18 
 
 
267 aa  105  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1527  hypothetical protein  32.3 
 
 
250 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2893  hypothetical protein  32.74 
 
 
272 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362582  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3174  hypothetical protein  33.49 
 
 
273 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1376  hypothetical protein  34.53 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0116  protein of unknown function DUF169  31.82 
 
 
265 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011799  hitchhiker  0.00705283 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2166  protein of unknown function DUF169  30.52 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1444  protein of unknown function DUF169  31.03 
 
 
281 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0915  hypothetical protein  30.46 
 
 
258 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.155446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2252  protein of unknown function DUF169  23.42 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0320  protein of unknown function DUF169  25.32 
 
 
284 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.129666  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2491  hypothetical protein  26.45 
 
 
296 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2533  hypothetical protein  27.03 
 
 
285 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>