60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0701 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0701  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  100 
 
 
515 aa  1021    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.187582  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0935  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  56.24 
 
 
509 aa  570  1e-161  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1624  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  50.1 
 
 
524 aa  500  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.931737  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1148  GHMP kinase group 1  42.02 
 
 
519 aa  387  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.820316  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0806  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  50.15 
 
 
321 aa  293  6e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1563  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  48.62 
 
 
319 aa  280  5e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1282  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  45.29 
 
 
325 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1394  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  45.29 
 
 
325 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.813401  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0674  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  44.68 
 
 
325 aa  276  8e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.2271  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0244  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  38.21 
 
 
335 aa  268  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1290  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  41.05 
 
 
325 aa  260  4e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1222  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  43.73 
 
 
318 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2861  GHMP family kinase  36.3 
 
 
347 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480231  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6481  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  36.75 
 
 
355 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.321836 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1345  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  37.54 
 
 
292 aa  160  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.380612  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1661  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  36.84 
 
 
310 aa  154  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00577565  normal  0.473342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1779  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  37.73 
 
 
333 aa  150  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0409011  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0527  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  39.02 
 
 
325 aa  147  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2356  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  35.88 
 
 
322 aa  144  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37342  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1616  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  36.59 
 
 
284 aa  143  6e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2430  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  35.15 
 
 
342 aa  144  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100364  normal  0.840747 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5949  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  35.03 
 
 
339 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00300733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1828  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  37.61 
 
 
340 aa  140  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2163  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  37.31 
 
 
340 aa  139  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0673427  normal  0.202366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6001  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  37.58 
 
 
333 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498595  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1348  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  37.24 
 
 
326 aa  131  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0110253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5777  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  35.26 
 
 
323 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3142  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family protein  24.57 
 
 
328 aa  128  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2384  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  35.07 
 
 
339 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2109  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  36.67 
 
 
328 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2038  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  37.09 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.172756  normal  0.249661 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0128  hypothetical protein  42.21 
 
 
170 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3535  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  35.4 
 
 
322 aa  120  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2350  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  32.08 
 
 
327 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0626  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  34.78 
 
 
345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3085  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  31.38 
 
 
348 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1262  hypothetical protein  41.29 
 
 
173 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2606  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  30.98 
 
 
342 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.614879  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1064  hypothetical protein  38.99 
 
 
171 aa  103  9e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.618696  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0792  sugar kinase-like protein  31.64 
 
 
310 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2423  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  28.33 
 
 
325 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.165612  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1697  hypothetical protein  39.62 
 
 
171 aa  102  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0579  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  30.33 
 
 
337 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.195323  normal  0.392757 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1562  hypothetical protein  38.36 
 
 
171 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.911918  normal  0.330509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0349  hypothetical protein  38.36 
 
 
171 aa  98.2  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0595803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3153  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  30.1 
 
 
375 aa  94.4  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1054  hypothetical protein  31.03 
 
 
168 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0169173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3957  hypothetical protein  27.27 
 
 
178 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5298  protein of unknown function DUF98  33.74 
 
 
223 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0556574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1826  GHMP kinase  27.24 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1451  GHMP kinase  23.48 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0518145  normal  0.0558976 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3390  hypothetical protein  25.16 
 
 
168 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.00000000204141 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1082  GHMP kinase  25.91 
 
 
360 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.145228  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0788  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  26.1 
 
 
359 aa  59.3  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.128792  hitchhiker  0.00000000549796 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2738  sugar kinase-like protein  25.98 
 
 
427 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3289  hypothetical protein  28.65 
 
 
183 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0394214  normal  0.677915 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0932  GHMP kinase  24.25 
 
 
355 aa  52  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1568  protein of unknown function DUF564  28.57 
 
 
203 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232035  hitchhiker  0.00190267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0515  hypothetical protein  28.3 
 
 
209 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228468  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18661  4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)  26.19 
 
 
206 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>