26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0072 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0072  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
134 aa  274  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0270  hypothetical protein  28.57 
 
 
417 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1779  hypothetical protein  28.04 
 
 
425 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.501115  normal  0.0869109 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4105  hypothetical protein  34.44 
 
 
444 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4013  hypothetical protein  31.03 
 
 
443 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169231  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0750  hypothetical protein  30.86 
 
 
475 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1615  hypothetical protein  29.21 
 
 
425 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  30.14 
 
 
382 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0797  hypothetical protein  31.51 
 
 
472 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0813  hypothetical protein  25.58 
 
 
474 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.86 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3210  hypothetical protein  25.56 
 
 
474 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0975  hypothetical protein  30 
 
 
474 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0493  vitamin K epoxide reductase  30 
 
 
342 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  36.21 
 
 
218 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3313  hypothetical protein  29.41 
 
 
474 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  27.5 
 
 
474 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3500  hypothetical protein  38.71 
 
 
481 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1212  hypothetical protein  30.68 
 
 
162 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3623  hypothetical protein  38.71 
 
 
481 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0864  hypothetical protein  38.71 
 
 
481 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3428  hypothetical protein  38.71 
 
 
481 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  44.74 
 
 
214 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0856  hypothetical protein  27.27 
 
 
152 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.386064  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3058  hypothetical protein  38.71 
 
 
473 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  35.48 
 
 
474 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>