44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0339 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0339  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  40 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  58.21 
 
 		 78 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2366  gas vesicle protein GVPa  48.72 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1485  gas vesicle protein GVPa  53.33 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0249757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  49.15 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0342  gas vesicle protein GVPa  49.09 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.842156  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  43.1 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  38.89 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  43.86 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  30.95 
 
 		 152 aa  52.4  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  39.39 
 
 		 69 aa  50.8  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  29.49 
 
 		 201 aa  48.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  36.84 
 
 		 104 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  38.78 
 
 		 121 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  35.09 
 
 		 104 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1260  gas vesicle protein GVPa  43.75 
 
 		 74 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128453  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  37.5 
 
 		 94 aa  45.1  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1803  gas vesicle protein GVPa  40.91 
 
 		 66 aa  44.7  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  39.58 
 
 		 70 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  39.58 
 
 		 70 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  33.9 
 
 		 71 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  38 
 
 		 68 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  38 
 
 		 68 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  38 
 
 		 68 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  38 
 
 		 68 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  38 
 
 		 68 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  38 
 
 		 68 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  35.71 
 
 		 95 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2408  gas vesicle protein GVPa  47.73 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  33.9 
 
 		 71 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  38 
 
 		 68 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  34 
 
 		 104 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  39.22 
 
 		 75 aa  42.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  39.22 
 
 		 76 aa  42.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  41.67 
 
 		 98 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3016  gas vesicle protein GVPa  34 
 
 		 71 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2839  gas vesicle synthesis protein GvpA  31.25 
 
 		 72 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  31.67 
 
 		 99 aa  41.6  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  33.33 
 
 		 72 aa  41.6  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  34 
 
 		 75 aa  40.8  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  30 
 
 		 97 aa  40.8  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.783723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>