18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0636 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0636  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  160  5e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00923819  hitchhiker  0.000274173 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4540  hypothetical protein  44.16 
 
 
138 aa  64.7  4e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0576  hypothetical protein  39.02 
 
 
105 aa  61.6  4e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24220  hypothetical protein  37.18 
 
 
107 aa  60.1  9e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1208  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  60.1  1e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0452  hypothetical protein  36.05 
 
 
121 aa  57  9e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1101  hypothetical protein  37.08 
 
 
135 aa  57  9e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121424  normal  0.0518739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0273  hypothetical protein  41.49 
 
 
108 aa  53.1  1e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28272  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0516  hypothetical protein  34.78 
 
 
125 aa  52.8  1e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3081  hypothetical protein  39.02 
 
 
129 aa  50.4  8e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4427  hypothetical protein  35.48 
 
 
100 aa  47.4  8e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2700  hypothetical protein  31.31 
 
 
115 aa  47.4  8e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5015  hypothetical protein  30.39 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17930  hypothetical protein  43.53 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2352  hypothetical protein  40.68 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0514  hypothetical protein  25.64 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0448  hypothetical protein  28.87 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3287  hypothetical protein  34.83 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>