17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1148 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1148  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  261  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  1.2989e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0229  hypothetical protein  61.79 
 
 
123 aa  166  8e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.942567  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0594  hypothetical protein  58.4 
 
 
124 aa  161  2e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1448  hypothetical protein  60 
 
 
124 aa  162  2e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.646721  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0843  conserved hypothetical protein (DUF1353 domain protein)  59.5 
 
 
123 aa  154  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  2.92478e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0023  hypothetical protein  43.86 
 
 
109 aa  105  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0126693  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1182  hypothetical protein  36.89 
 
 
130 aa  60.1  1e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51944  normal  0.653749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3602  protein of unknown function DUF1353  38.18 
 
 
261 aa  54.7  5e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2242  hypothetical protein  35.71 
 
 
124 aa  54.7  5e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.221816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1324  hypothetical protein  36.7 
 
 
125 aa  53.9  7e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0693  hypothetical protein  26.44 
 
 
112 aa  49.3  2e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0940  hypothetical protein  34.58 
 
 
139 aa  48.1  4e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0158947  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1881  hypothetical protein  36.71 
 
 
139 aa  47.4  7e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00249021  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3824  hypothetical protein  31.19 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3096  hypothetical protein  33.78 
 
 
230 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495233  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0794  hypothetical protein  38.71 
 
 
252 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  1.33261e-06 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2508  hypothetical protein  40.82 
 
 
197 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.92885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>