12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3284 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3284    100 
 
 
171 bp  339  9.999999999999999e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0315896 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2571  transposase, IS605 OrfB family  89.47 
 
 
1242 bp  131  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2840  transposase, IS605 OrfB family  88.89 
 
 
1242 bp  119  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249005  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3190  transposase, IS605 OrfB family  90.8 
 
 
1290 bp  109  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3397  transposase, IS605 OrfB family  87.5 
 
 
1224 bp  103  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0982    87.21 
 
 
1113 bp  83.8  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3051  transposase, IS605 OrfB family  84.38 
 
 
1299 bp  71.9  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3927  transposase, IS605 OrfB family  93.33 
 
 
1230 bp  65.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.770218  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2314  transposase, IS605 OrfB family  82.3 
 
 
1260 bp  61.9  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2852    84.15 
 
 
1271 bp  60  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1261    91.3 
 
 
888 bp  60  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0939273  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0812  transposase, IS605 OrfB family  93.55 
 
 
1257 bp  46.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.639137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>