42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1342 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1342  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  100 
 
 
408 aa  833    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0795325  normal  0.948696 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1684  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  71.29 
 
 
429 aa  599  1e-170  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0305327  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2692  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  72.44 
 
 
410 aa  595  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1005  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  68.43 
 
 
419 aa  584  1.0000000000000001e-165  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.538878  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2149  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  59.01 
 
 
440 aa  490  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1445  LOR/SDH bifunctional protein  56.93 
 
 
409 aa  478  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0938  hypothetical protein  53.47 
 
 
409 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.182607  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1408  LOR/SDH bifunctional protein  53.71 
 
 
411 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000543179  normal  0.449844 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0299  LOR/SDH bifunctional protein  52.38 
 
 
410 aa  429  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0372  LOR/SDH bifunctional protein  51.89 
 
 
415 aa  421  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216176  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0465  LOR/SDH bifunctional protein  51.64 
 
 
415 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1454  LOR/SDH bifunctional protein  51.13 
 
 
415 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0533  LOR/SDH bifunctional protein  50.88 
 
 
415 aa  414  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.990735  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0845  LOR/SDH bifunctional protein  48.15 
 
 
417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0686  hypothetical protein  47.79 
 
 
409 aa  404  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0863  LOR/SDH bifunctional protein  45.39 
 
 
407 aa  389  1e-107  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00957303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3107  LOR/SDH bifunctional protein  47.16 
 
 
435 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0636  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  44.89 
 
 
450 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4864  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  47.3 
 
 
412 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0701737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  45.34 
 
 
703 aa  359  5e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  46.57 
 
 
705 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2163  hypothetical protein  45.64 
 
 
405 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106153  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  46.32 
 
 
705 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  43.73 
 
 
703 aa  350  3e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  45.21 
 
 
704 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  44.12 
 
 
705 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  43.98 
 
 
703 aa  339  4e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1826  LOR/SDH bifunctional protein  39.71 
 
 
411 aa  289  6e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.263588  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3091  LOR/SDH bifunctional enzyme region  39.71 
 
 
414 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05900  hypothetical protein  35.38 
 
 
363 aa  188  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.598804 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1451  hypothetical protein  32.87 
 
 
372 aa  184  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.553711  normal  0.492787 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2488  hypothetical protein  36.44 
 
 
363 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.492113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1885  hypothetical protein  34.88 
 
 
369 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2787  hypothetical protein  35.28 
 
 
364 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0554  hypothetical protein  35.65 
 
 
380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2325  hypothetical protein  34.62 
 
 
369 aa  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0121  hypothetical protein  32.8 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0048  hypothetical protein  33.33 
 
 
365 aa  159  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2463  hypothetical protein  38.91 
 
 
431 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4880  hypothetical protein  27.89 
 
 
362 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0025  hypothetical protein  27.87 
 
 
392 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0026  hypothetical protein  27.3 
 
 
367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>