48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0542 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0542  Cobalt transport protein CbiN  100 
 
 		 101 aa  191  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3590  Cobalt transport protein CbiN  52.22 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1758  cobalt transport protein CbiN  44.55 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0186  cobalt transport protein CbiN  35 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.51838  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0183  cobalt transport protein CbiN  35 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2594  cobalt transport protein CbiN  47.06 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.197619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3821  cobalt transport protein  43 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3659  cobalt transport protein CbiN  40.19 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.999431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0928  cobalt transport protein  45.98 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.195338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1267  cobalt transport protein  52.05 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1004  Cobalt transport protein CbiN  50.62 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0096  cobalt transport protein CbiN  40.23 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2732  cobalt transport protein CbiN  37.76 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.701075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0324  cobalt transport protein  48.53 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0241813  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1192  cobalt transport protein CbiN  40.23 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0145  cobalt transport protein CbiN  42.22 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00778017  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0726  cobalt transport protein CbiN  40.23 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.685359  normal  0.216079 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2602  cobalt transport protein  49.33 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2357  cobalt transport protein CbiN  38.82 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.22776 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2144  cobalt transport protein CbiN  38.82 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2191  cobalt transport protein CbiN  38.82 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.475152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2244  cobalt transport protein CbiN  38.82 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.123156 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2198  cobalt transport protein CbiN  38.82 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1860  cobalt transport protein  41.18 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2619  cobalt transport protein CbiN  46.91 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0530  cobalt transport protein CbiN  43.84 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4720  cobalt transport protein  49.25 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0713  cobalt transport protein  42.67 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1061  cobalt transport protein CbiN  57.14 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.019585  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2792  cobalt transport protein CbiN  44.87 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180133  decreased coverage  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3735  Cobalt transport protein CbiN  42.03 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1703  Cobalt transport protein CbiN  32.18 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.66307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1084  hypothetical protein  34.62 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1221  cobalt transport protein CbiN  42.11 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1708  cobalt transport protein CbiN  28.57 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0791  cobalt transport protein CbiN  39.51 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1294  cobalt transport protein CbiN  33.73 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00272404  normal  0.0249047 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1217  cobalt transport protein CbiN  32.95 
 
 		 105 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1696  cobalt transport protein CbiN  52.73 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.292366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0561  cobalt transport protein  45.07 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2146  cobalt transport protein CbiN  35.16 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217949  normal  0.496268 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0579  cobalt transport protein CbiN  39.73 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1225  cobalt transport protein CbiN  47.22 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1275  Cobalt transport protein CbiN  54.76 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1386  cobalt transport protein CbiN  32.38 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1699  cobalt transport binding protein  35.16 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000732427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1240  cobalt transport protein CbiN  42.11 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.258486  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1546  cobalt transport protein CbiN  36.99 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000366072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>