23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4443 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4581  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  96.38 
 
 
1311 bp  920    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4443    100 
 
 
560 bp  1110    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0149314  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0738  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  96.38 
 
 
1311 bp  920    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0040  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  96.38 
 
 
1311 bp  920    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1436    86.26 
 
 
1318 bp  117  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.295411 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  85.26 
 
 
1317 bp  77.8  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20360  transposase  87.88 
 
 
1308 bp  67.9  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24200  transposase family protein  87.88 
 
 
1308 bp  67.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21460  transposase family protein  87.88 
 
 
1308 bp  67.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  unclonable  1.3054300000000002e-18  hitchhiker  0.0000742439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17110  transposase family protein  87.88 
 
 
1308 bp  67.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17100    87.88 
 
 
2292 bp  67.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0207297  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02160  transposase family protein  87.88 
 
 
1308 bp  67.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290407  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02150  transposase family protein  87.88 
 
 
1308 bp  67.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00530  transposase  87.88 
 
 
1308 bp  67.9  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21140  transposase family protein  87.69 
 
 
1353 bp  65.9  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07920    87.69 
 
 
1267 bp  65.9  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23830  transposase family protein  87.69 
 
 
1353 bp  65.9  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25640  transposase family protein  87.69 
 
 
1329 bp  65.9  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05340    87.69 
 
 
1267 bp  65.9  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05280    87.69 
 
 
1297 bp  65.9  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00920    87.69 
 
 
1261 bp  65.9  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23480  transposase family protein  84.85 
 
 
1317 bp  52  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06980  transposase family protein  84.85 
 
 
1317 bp  52  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>