20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4044 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4044  protein of unknown function DUF456  100 
 
 
159 aa  283  5.999999999999999e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0664  hypothetical protein  48 
 
 
157 aa  124  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0288472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1686  protein of unknown function DUF456  48.68 
 
 
158 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1532  hypothetical protein  53.15 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0624636  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0095  hypothetical protein  43.66 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0104  hypothetical protein  43.66 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0085  hypothetical protein  43.66 
 
 
160 aa  111  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.296406 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3993  hypothetical protein  39.19 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0737  hypothetical protein  44.87 
 
 
161 aa  92  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27270  Protein of unknown function (DUF456)  42.45 
 
 
170 aa  91.3  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.236002  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2960  hypothetical protein  52.32 
 
 
158 aa  90.9  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0112  hypothetical protein  45.57 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0722  hypothetical protein  49.68 
 
 
159 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16000  Protein of unknown function (DUF456)  40.14 
 
 
166 aa  88.6  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.148783  normal  0.0914905 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3772  protein of unknown function DUF456  39.07 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2540  protein of unknown function DUF456  46.72 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.658317  normal  0.52211 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19890  hypothetical protein  40.46 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.649353  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1497  hypothetical protein  40.16 
 
 
220 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28240  hypothetical protein  44.78 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4908  hypothetical protein  39.68 
 
 
161 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.417496  decreased coverage  0.00174056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>