More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3159 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3159  PhoH family protein  100 
 
 
343 aa  686  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00307849  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3832  PhoH family protein  74.26 
 
 
351 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3467  PhoH family protein  73.8 
 
 
357 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2762  PhoH family protein  73.35 
 
 
361 aa  494  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0978111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3519  PhoH family protein  73.8 
 
 
357 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12394  phoH-like protein phoH1 (phosphate starvation-inducible protein psiH)  76.27 
 
 
352 aa  494  1e-138  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3456  PhoH-like protein  75.08 
 
 
319 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745001  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2706  PhoH family protein  70.8 
 
 
353 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4627  PhoH family protein  70.19 
 
 
344 aa  466  1e-130  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13580  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  70.57 
 
 
349 aa  465  1e-130  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.340051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3832  PhoH family protein  70.25 
 
 
329 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3453  PhoH family protein  69.49 
 
 
380 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.127019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1658  PhoH family protein  72.47 
 
 
376 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1267  PhoH-like protein  71.38 
 
 
345 aa  447  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2295  PhoH family protein  72.79 
 
 
354 aa  447  1e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0844  phosphate starvation-inducible protein PhoH ATPase  68.18 
 
 
381 aa  444  1e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2112  PhoH family protein  68.32 
 
 
354 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1576  PhoH family protein  69.7 
 
 
355 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0922563  normal  0.0310303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1750  PhoH family protein  68.92 
 
 
376 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224703  normal  0.417547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3247  PhoH family protein  72.97 
 
 
348 aa  440  1e-122  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0707  PhoH family protein  70.32 
 
 
369 aa  438  1e-122  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1912  PhoH family protein  69.28 
 
 
345 aa  437  1e-122  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1156  PhoH family protein  69.18 
 
 
340 aa  439  1e-122  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.980193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3387  PhoH family protein  67.82 
 
 
375 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2232  PhoH family protein  68.83 
 
 
362 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00260346  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2188  PhoH family protein  68.54 
 
 
345 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7049  PhoH family protein  71.1 
 
 
393 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1969  PhoH family protein  67.63 
 
 
362 aa  425  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.03344e-07 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2206  PhoH family protein  68.44 
 
 
333 aa  425  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11730  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  68.08 
 
 
346 aa  427  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.332483  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0789  PhoH family protein  69.26 
 
 
333 aa  417  1e-115  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0567134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13470  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  63.64 
 
 
353 aa  408  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.112875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17250  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  60.54 
 
 
350 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.465991  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1546  PhoH family protein  62.91 
 
 
350 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12340  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  59.1 
 
 
357 aa  366  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1272  PhoH family protein  55.31 
 
 
325 aa  344  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4280  PhoH family protein  56.82 
 
 
323 aa  342  7e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1272  PhoH-like protein protein  56.48 
 
 
352 aa  337  2e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31699  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2849  PhoH family protein  57.78 
 
 
338 aa  334  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.489478  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  57.24 
 
 
323 aa  328  6e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2303  PhoH family protein  51.67 
 
 
361 aa  328  6e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76142  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  54.15 
 
 
328 aa  328  6e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  51.85 
 
 
359 aa  325  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1249  PhoH family protein  73.06 
 
 
654 aa  325  6e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  56.73 
 
 
329 aa  323  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  54.58 
 
 
340 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  54.05 
 
 
340 aa  321  1e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12960  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  58.06 
 
 
326 aa  320  2e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal  0.0890073 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1643  PhoH family protein  60.4 
 
 
318 aa  320  3e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00468401  hitchhiker  0.00249852 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0255  PhoH family protein  51.42 
 
 
328 aa  319  5e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2163  PhoH family protein  54.29 
 
 
344 aa  315  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0763863  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  54.21 
 
 
339 aa  315  8e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  48.73 
 
 
322 aa  313  3e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0593  PhoH-like protein  52.73 
 
 
333 aa  311  8e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.318782  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1985  PhoH family protein  53.49 
 
 
323 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.460583  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  54.93 
 
 
336 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2484  PhoH family protein  52.3 
 
 
320 aa  309  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  51.16 
 
 
319 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  51.16 
 
 
319 aa  308  9e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  51.16 
 
 
319 aa  308  9e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  51.16 
 
 
319 aa  308  9e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  51.16 
 
 
319 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  50.33 
 
 
319 aa  307  1e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  49.68 
 
 
348 aa  308  1e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.31138e-09  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  52.33 
 
 
320 aa  308  1e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  52.81 
 
 
332 aa  307  2e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1415  PhoH family protein  50.79 
 
 
332 aa  307  2e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  52.81 
 
 
332 aa  307  2e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  51.16 
 
 
319 aa  306  2e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.88335e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0735  PhoH family protein  51.27 
 
 
335 aa  307  2e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.855144  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2611  PhoH family protein  51.27 
 
 
351 aa  306  2e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  51.16 
 
 
319 aa  306  2e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2713  PhoH family protein  54.07 
 
 
356 aa  307  2e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  52.81 
 
 
332 aa  307  2e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  49.22 
 
 
333 aa  306  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3070  PhoH family protein  51.85 
 
 
324 aa  306  4e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  8.42405e-07 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2813  PhoH family protein  52.37 
 
 
359 aa  305  6e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2905  PhoH family protein  52.37 
 
 
359 aa  305  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.21329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  50.83 
 
 
319 aa  305  8e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  51.46 
 
 
350 aa  305  8e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  51.82 
 
 
332 aa  305  1e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  51.14 
 
 
365 aa  304  1e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  53.11 
 
 
340 aa  305  1e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1507  PhoH family protein  50 
 
 
345 aa  304  1e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048361  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  51.22 
 
 
340 aa  304  1e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  50.5 
 
 
319 aa  304  2e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1511  PhoH-like protein  53.82 
 
 
303 aa  303  2e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2721  PhoH-like protein  53.8 
 
 
354 aa  303  3e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  50.5 
 
 
319 aa  303  3e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  53.49 
 
 
334 aa  303  4e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0579  PhoH family protein  51.76 
 
 
318 aa  302  4e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.818814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1024  PhoH family protein  51.8 
 
 
320 aa  302  6e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  51.79 
 
 
333 aa  302  7e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  53.27 
 
 
340 aa  301  8e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  53.27 
 
 
327 aa  301  9e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0134  PhoH family protein  51.51 
 
 
319 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  50.81 
 
 
347 aa  300  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1145  PhoH family protein  50.16 
 
 
317 aa  299  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0474  PhoH-like protein  52.17 
 
 
322 aa  299  4e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1120  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  49.67 
 
 
319 aa  299  5e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>