34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0023 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0023  protein of unknown function UPF0233  100 
 
 		 96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245647  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0815  putative septation inhibitor protein  61.86 
 
 		 93 aa  120  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144897  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0012  putative septation inhibitor protein  60.42 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0020  putative septation inhibitor protein  60.42 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0181383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0012  putative septation inhibitor protein  60.42 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.395634 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0025  protein of unknown function UPF0233  64.29 
 
 		 97 aa  117  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.389435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0019  putative septation inhibitor protein  59.38 
 
 		 93 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10011  putative septation inhibitor protein  55.21 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0016  putative septation inhibitor protein  59.79 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00290  putative septation inhibitor protein  62.89 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348658  normal  0.0596427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0032  protein of unknown function UPF0233  49.49 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0071  protein of unknown function UPF0233  49.04 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0043  putative septation inhibitor protein  34.38 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00730  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0021  protein of unknown function UPF0233  35.42 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0016  hypothetical protein  36.46 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269792  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0013  protein of unknown function UPF0233  38.61 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0057  hypothetical protein  36.08 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0131  hypothetical protein  35.05 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120533  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0020  protein of unknown function UPF0233  38.54 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0059  protein of unknown function UPF0233  38.54 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0016  protein of unknown function UPF0233  33.33 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000113441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0107  hypothetical protein  35.42 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5245  protein of unknown function UPF0233  31.25 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0646831  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1387  putative septation inhibitor protein  41.54 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000180482  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6132  hypothetical protein  37.76 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0053  hypothetical protein  34.69 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0058  hypothetical protein  33.67 
 
 		 87 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4439  hypothetical protein  34.38 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105645  normal  0.316052 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0166  protein of unknown function UPF0233  32.65 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0014  putative septation inhibitor protein  35.42 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0025  protein of unknown function UPF0233  33.33 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.154771  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00150  Uncharacteriszd protein family (UPF0233)  27.55 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0020  hypothetical protein  32.5 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>