16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0272 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0272  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  370  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0102  hypothetical protein  75.27 
 
 		 184 aa  286  8e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000238688  normal  0.914343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0123  hypothetical protein  55.56 
 
 		 184 aa  218  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00112268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0701  hypothetical protein  51.11 
 
 		 189 aa  197  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.154886  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0092  hypothetical protein  50 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0068181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0075  hypothetical protein  49.73 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.95667e-36 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0500  hypothetical protein  44.32 
 
 		 205 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000708354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2935  hypothetical protein  37.43 
 
 		 177 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.23691e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0016  hypothetical protein  32.67 
 
 		 237 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0015  hypothetical protein  32.54 
 
 		 248 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0015  hypothetical protein  31.9 
 
 		 246 aa  90.9  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0015  hypothetical protein  31.58 
 
 		 241 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0352  hypothetical protein  35.23 
 
 		 360 aa  71.2  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0269  hypothetical protein  26.5 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3424  hypothetical protein  31.25 
 
 		 543 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.163574  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3488  hypothetical protein  31.25 
 
 		 543 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>