11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2383 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2383  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0932192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2071  hypothetical protein  41.7 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.686043  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1560  S-layer-like protein array-related protein  30.61 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.39656 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0720  hypothetical protein  31.63 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0391  S-layer-like protein array-related protein  27.55 
 
 		 196 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0608317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  27.27 
 
 		 456 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  27.27 
 
 		 456 aa  47  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0814  PEGA domain-containing protein  27.73 
 
 		 341 aa  45.8  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3019  hypothetical protein  25.23 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6051  OmpA/MotB domain protein  25.47 
 
 		 642 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7209  OmpA/MotB domain protein  24.53 
 
 		 652 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0110011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>