14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5525 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5525  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  267  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5329  hypothetical protein  65.44 
 
 		 135 aa  173  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0343957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1140  hypothetical protein  64.12 
 
 		 134 aa  170  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.180925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1026  hypothetical protein  62.6 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.533429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6310  plasmid replication, integration and excision activator  64.12 
 
 		 134 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.370605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5541  plasmid replication, integration and excision activator  64.12 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4271  hypothetical protein  61.29 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000446812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5287  hypothetical protein  53.12 
 
 		 136 aa  123  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8555  hypothetical protein  52.17 
 
 		 139 aa  114  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149601  hitchhiker  0.000517755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0153  hypothetical protein  48.8 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0698  hypothetical protein  46.77 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.353371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0045  hypothetical protein  42.34 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6359  hypothetical protein  43.43 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0918  hypothetical protein  36.88 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>