12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2196 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2196  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  762    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.455714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3030  hypothetical protein  66.93 
 
 		 500 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2978  hypothetical protein  49.47 
 
 		 514 aa  323  4e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  hitchhiker  0.00212324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1074  hypothetical protein  49.74 
 
 		 514 aa  322  8e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.729157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2821  hypothetical protein  49.21 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4374  hypothetical protein  49.21 
 
 		 514 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.200864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4073  hypothetical protein  51.39 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0371  hypothetical protein  28 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0372  hypothetical protein  28 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000191651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0398  hypothetical protein  28 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000077648  normal  0.524896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0954  hypothetical protein  28 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  hitchhiker  0.0000000572086 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2521  hypothetical protein  28 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>