22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4374 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4374  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  1028    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.200864  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2978  hypothetical protein  98.25 
 
 
514 aa  1013    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  hitchhiker  0.00212324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2821  hypothetical protein  98.49 
 
 
398 aa  788    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1074  hypothetical protein  98.25 
 
 
514 aa  1011    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3030  hypothetical protein  42.94 
 
 
500 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2196  hypothetical protein  49.21 
 
 
381 aa  314  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.455714  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0372  hypothetical protein  22.72 
 
 
466 aa  69.7  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000191651  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0398  hypothetical protein  22.72 
 
 
466 aa  69.7  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000077648  normal  0.524896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0954  hypothetical protein  22.36 
 
 
466 aa  63.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  hitchhiker  0.0000000572086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4073  hypothetical protein  54 
 
 
190 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0371  hypothetical protein  27.74 
 
 
172 aa  58.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232238  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2521  hypothetical protein  22.83 
 
 
371 aa  58.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2195  hypothetical protein  37.37 
 
 
124 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272656  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0374  hypothetical protein  23.85 
 
 
293 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000778981  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1954  hypothetical protein  40.28 
 
 
471 aa  44.3  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0069339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0573  hypothetical protein  38.89 
 
 
325 aa  43.9  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0622  hypothetical protein  38.89 
 
 
472 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0407627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0780  hypothetical protein  38.89 
 
 
472 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1527  hypothetical protein  38.89 
 
 
472 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1922  hypothetical protein  38.89 
 
 
472 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2239  hypothetical protein  38.89 
 
 
472 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.685977  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0030  hypothetical protein  38.89 
 
 
472 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00177404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>