24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2821 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4374  hypothetical protein  98.49 
 
 
514 aa  788    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.200864  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2978  hypothetical protein  97.99 
 
 
514 aa  763    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  hitchhiker  0.00212324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2821  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  796    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1074  hypothetical protein  98.49 
 
 
514 aa  790    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2196  hypothetical protein  49.21 
 
 
381 aa  316  6e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.455714  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3030  hypothetical protein  43.72 
 
 
500 aa  300  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4073  hypothetical protein  56 
 
 
190 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0371  hypothetical protein  27.74 
 
 
172 aa  55.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232238  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2521  hypothetical protein  26.51 
 
 
371 aa  54.3  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0954  hypothetical protein  26.51 
 
 
466 aa  53.9  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  hitchhiker  0.0000000572086 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0398  hypothetical protein  26.51 
 
 
466 aa  53.9  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000077648  normal  0.524896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0372  hypothetical protein  26.51 
 
 
466 aa  53.9  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000191651  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1954  hypothetical protein  40.28 
 
 
471 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0069339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0030  hypothetical protein  38.89 
 
 
472 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00177404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0780  hypothetical protein  38.89 
 
 
472 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0573  hypothetical protein  38.89 
 
 
325 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0622  hypothetical protein  38.89 
 
 
472 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0407627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2239  hypothetical protein  38.89 
 
 
472 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.685977  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1922  hypothetical protein  38.89 
 
 
472 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1527  hypothetical protein  38.89 
 
 
472 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0770  hypothetical protein  38.89 
 
 
472 aa  43.5  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1109  hypothetical protein  38.89 
 
 
472 aa  43.5  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00916427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0981  hypothetical protein  38.89 
 
 
472 aa  43.5  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0817  hypothetical protein  38.89 
 
 
399 aa  43.1  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>