258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2808 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2808  ribosomal protein L36  100 
 
 
37 aa  75.1  3e-13  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  3.1585e-08  hitchhiker  1.95432e-08 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19750  LSU ribosomal protein L36P  100 
 
 
37 aa  75.1  3e-13  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00973843  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01410  LSU ribosomal protein L36P  97.3 
 
 
37 aa  74.3  6e-13  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0615233  normal  0.988517 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1137  ribosomal protein L36  94.59 
 
 
37 aa  73.2  1e-12  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  9.48568e-05  normal  0.0431447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1363  ribosomal protein L36  89.19 
 
 
37 aa  68.9  2e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0446  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  68.2  4e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250661  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3879  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  67.8  5e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0422  ribosomal protein L36  86.49 
 
 
37 aa  67.8  5e-11  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1551  ribosomal protein L36  86.49 
 
 
37 aa  67.4  6e-11  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0356  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  67.4  7e-11  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0589  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  67  8e-11  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314897  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1975  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  66.2  1e-10  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.341168  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0651  ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  66.6  1e-10  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29490  LSU ribosomal protein L36P  83.78 
 
 
37 aa  66.6  1e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144849  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1168  ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  66.2  1e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0960  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  66.6  1e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6587  ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  66.2  1e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.184599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4483  ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  66.2  2e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.884405  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0712  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  66.2  2e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.22177 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2943  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  65.1  3e-10  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.702617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2658  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  65.1  3e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0606  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  65.5  3e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1114  LSU ribosomal protein L36P  81.08 
 
 
37 aa  65.5  3e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323838  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0330  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  65.1  3e-10  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.121743  decreased coverage  0.000353679 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2629  ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  65.1  3e-10  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4294  ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  65.5  3e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2595  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  65.1  3e-10  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0561863  normal  0.639398 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0610  ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  64.7  4e-10  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675982  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23231  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  64.7  4e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0131  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  64.3  5e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3116  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  64.3  5e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3724  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  64.3  5e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2687  ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  64.3  5e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00180779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0239  ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  64.3  5e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.36558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0135  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  64.3  5e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  5.44663e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1754  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  64.3  6e-10  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0091  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  64.3  6e-10  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0580273  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1763  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  64.3  6e-10  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01410  ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  63.9  7e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.50249e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04220  LSU ribosomal protein L36P  72.97 
 
 
37 aa  63.5  9e-10  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.383855  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1844  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  63.2  1e-09  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1109  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  62.8  1e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1250  50S ribosomal protein L36P  81.08 
 
 
41 aa  62.8  1e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000204955  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0134  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  63.2  1e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  8.09318e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0129  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  63.2  1e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  2.56453e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23560  LSU ribosomal protein L36P  75.68 
 
 
37 aa  63.2  1e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1126  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  62.8  1e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.384917  normal  0.806869 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20630  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  63.2  1e-09  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0927005  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1432  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  62.8  1e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.846939  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2295  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  63.2  1e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2254  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  63.2  1e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.031997  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0165  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  63.2  1e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.1135e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5171  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  63.2  1e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.96935e-11  unclonable  4.53909e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0134  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  63.2  1e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  3.70464e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0128  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  63.2  1e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.90625e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0147  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  63.2  1e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.12263e-62 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1138  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  62.8  1e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.353832 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0134  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  63.2  1e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.59477e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0155  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  63.2  1e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  6.28641e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16930  LSU ribosomal protein L36P  75.68 
 
 
37 aa  63.5  1e-09  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2928  50S ribosomal protein L36P  78.38 
 
 
37 aa  62  2e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.66918e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1004  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  62.8  2e-09  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  5.66406e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2621  50S ribosomal protein L36P  75.68 
 
 
37 aa  62  2e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.775374  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3899  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  62.8  2e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4290  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  62.4  2e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.856971  hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2883  ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  62.4  2e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472397  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13498  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  62.8  2e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03834e-12  normal  0.841805 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1730  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  61.6  3e-09  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.544238  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0228  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  62  3e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000229523  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1808  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  61.6  3e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452261  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  62  3e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1500  ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  61.6  3e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0891  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
46 aa  61.2  4e-09  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.31668e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1721  ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  61.2  4e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  5.18993e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0274  ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  61.2  4e-09  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17201  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
38 aa  61.6  4e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0101  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  61.2  5e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0783  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  60.8  5e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.59865e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0337  ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  60.8  5e-09  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2435  50S ribosomal protein L36P  72.97 
 
 
37 aa  61.2  5e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1743  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  61.2  5e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919945  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0682  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  60.8  6e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2374  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  60.8  6e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2235  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  60.8  6e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00944061  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2689  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  60.8  6e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2580  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  60.5  8e-09  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129778  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3673  ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  60.5  9e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5149  ribosomal protein L36  70.27 
 
 
37 aa  60.1  9e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.982294  normal  0.58314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2308  ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  60.1  1e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000112956  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0289  ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  59.7  1e-08  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  4.62447e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1946  ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  58.9  2e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0313  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00358606  unclonable  6.93478e-29 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3971  ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  58.9  2e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0310  ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  58.9  2e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.696988  normal  0.327601 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2991  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  59.3  2e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2043  ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  58.9  2e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.33507e-05  hitchhiker  0.000165902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3386  ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  58.9  2e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0249  ribosomal protein L36  70.27 
 
 
37 aa  58.5  3e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.07558e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl147  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 
37 aa  58.5  3e-08  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.31262e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0712  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  58.5  3e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  8.97597e-12  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>