14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1344 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1344  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  832    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2573  hypothetical protein  40.65 
 
 
386 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.298255  normal  0.109685 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5367  hypothetical protein  31.64 
 
 
403 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.128779  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1305  hypothetical protein  31.68 
 
 
413 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0049  hypothetical protein  32.62 
 
 
401 aa  166  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722506  hitchhiker  0.00143766 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1130  hypothetical protein  62.69 
 
 
175 aa  80.9  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.659523  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0865  hypothetical protein  51.67 
 
 
114 aa  64.7  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2121  hypothetical protein  46.77 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0895  hypothetical protein  49.09 
 
 
77 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0032  hypothetical protein  38.89 
 
 
323 aa  53.9  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  43.66 
 
 
570 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1752  hypothetical protein  27.19 
 
 
333 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0331  hypothetical protein  27.59 
 
 
331 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3340  hypothetical protein  30.28 
 
 
237 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>