60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2512 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2512  protein of unknown function DUF503  100 
 
 
102 aa  210  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3163  hypothetical protein  82.29 
 
 
116 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2434  hypothetical protein  82.29 
 
 
96 aa  166  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.211063  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0058  protein of unknown function DUF503  66.67 
 
 
105 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2415  protein of unknown function DUF503  55.79 
 
 
95 aa  102  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0494  protein of unknown function DUF503  48.94 
 
 
95 aa  92.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.750456  normal  0.915938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1275  hypothetical protein  37.63 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1229  hypothetical protein  39.29 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.172595  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1260  protein of unknown function DUF503  35.48 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873275  normal  0.807487 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0887  hypothetical protein  42.35 
 
 
93 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1704  Adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase  42.17 
 
 
280 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2320  protein of unknown function DUF503  37.35 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0422608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4216  hypothetical protein  44.78 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.472071  normal  0.0308507 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  39.51 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  37.23 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2048  protein of unknown function DUF503  28.26 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  35.11 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3850  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3859  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000276858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3663  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.394752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3949  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3553  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3571  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1334  hypothetical protein  30.11 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0659089  hitchhiker  0.00140554 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3910  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.359011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1156  protein of unknown function DUF503  27.17 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3634  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0542706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3704  hypothetical protein  34.07 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.349544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1556  hypothetical protein  32.26 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278609  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0859  hypothetical protein  36.49 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1209  protein of unknown function DUF503  35.9 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00247478  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0859  protein of unknown function DUF503  32.93 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2464  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0145218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3603  protein of unknown function DUF503  38.67 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15590  hypothetical protein  31.34 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1142  hypothetical protein  38.36 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0433815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1705  hypothetical protein  42.35 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000331281  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1837  protein of unknown function DUF503  27.08 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0968  hypothetical protein  35.14 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3823  hypothetical protein  29.76 
 
 
83 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8421e-63 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1545  hypothetical protein  33.72 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000254696  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3583  hypothetical protein  29.73 
 
 
115 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2411  hypothetical protein  42.19 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137349  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1163  protein of unknown function DUF503  38.36 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.517252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1743  protein of unknown function DUF503  29.47 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1231  protein of unknown function DUF503  38.36 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0180533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1103  hypothetical protein  38.36 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1452  hypothetical protein  39.08 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.454919  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2992  protein of unknown function DUF503  31.4 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  31.51 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3965  protein of unknown function DUF503  32.88 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0361  protein of unknown function DUF503  26.09 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_841  hypothetical protein  31.08 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0394209  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1157  hypothetical protein  43.55 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388094  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0584  hypothetical protein  30.77 
 
 
96 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1177  hypothetical protein  39.22 
 
 
100 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3222  protein of unknown function DUF503  29.27 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.26289 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  31.51 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2730  protein of unknown function DUF503  37.33 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3034  hypothetical protein  24.47 
 
 
104 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00080988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>