49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3022 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 78 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1485  gas vesicle protein GVPa  55.13 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0249757  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  60.26 
 
 		 230 aa  87.8  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  58.06 
 
 		 75 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0339  hypothetical protein  58.21 
 
 		 181 aa  80.1  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2366  gas vesicle protein GVPa  56.72 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  54.24 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  53.45 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0342  gas vesicle protein GVPa  54.9 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.842156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  61.22 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  53.85 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  49.06 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  48.08 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  43.1 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  45.83 
 
 		 69 aa  50.8  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  38.6 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  38.6 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  48.08 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  31.08 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1803  gas vesicle protein GVPa  41.18 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  39.62 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  41.67 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  40.38 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  32.84 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  31.67 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  30 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  34.69 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  34.69 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  36.07 
 
 		 119 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  38.3 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  34.69 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  34.69 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  37.25 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  37.25 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  34.69 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  34.69 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  37.7 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  33.33 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  37.7 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  37.7 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1260  gas vesicle protein GVPa  35.29 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128453  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  34.69 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  38.89 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2349  gas vesicle protein GVPa  36.73 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  39.29 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  36.73 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  36.17 
 
 		 72 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  33.96 
 
 		 94 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  36.73 
 
 		 72 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>