129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0070 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0070  3D domain-containing protein  100 
 
 
309 aa  628  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  48.51 
 
 
347 aa  209  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  42.06 
 
 
473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  42.49 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  41.38 
 
 
295 aa  183  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  35.27 
 
 
320 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0170  3D domain protein  37.15 
 
 
356 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  38.62 
 
 
343 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  38.49 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  41.38 
 
 
389 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  37.66 
 
 
340 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1485  hypothetical protein  36.76 
 
 
337 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0902184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1755  3D/G5 domain-containing protein  37.01 
 
 
337 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0155865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0050  hypothetical protein  38.89 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0069  3D domain-containing protein  32.16 
 
 
275 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  34.92 
 
 
352 aa  132  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1828  3D domain protein  35.06 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.937918  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  30.14 
 
 
342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  31.58 
 
 
401 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  33.46 
 
 
406 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0069  3D domain protein  37.23 
 
 
282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000398521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  43.48 
 
 
204 aa  93.2  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0651  hypothetical protein  49.33 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0595  hypothetical protein  49.33 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0685  hypothetical protein  49.33 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00231685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2759  3D domain-containing protein  30.43 
 
 
575 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00579221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  28.35 
 
 
570 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1437  3D domain-containing protein  43.96 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00168198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2756  hypothetical protein  29.82 
 
 
440 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00725843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2705  hypothetical protein  42.68 
 
 
524 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2684  hypothetical protein  42.68 
 
 
524 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0188967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2967  hypothetical protein  29.82 
 
 
440 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000478189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3009  enterotoxin  42.68 
 
 
548 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3766  hypothetical protein  50.77 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000229315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2968  enterotoxin  32.53 
 
 
529 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2273  enterotoxin  42.68 
 
 
500 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0333544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2964  enterotoxin  42.68 
 
 
488 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000376462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3743  hypothetical protein  50.77 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00197762  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3461  enterotoxin/cell-wall binding protein  50.77 
 
 
310 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000115171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3475  enterotoxin/cell wall-binding protein  50.77 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0617059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3725  hypothetical protein  50.77 
 
 
310 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9172500000000004e-32 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1243  hypothetical protein  43.96 
 
 
410 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.015154  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3815  hypothetical protein  33.15 
 
 
316 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4935  enterotoxin/cell wall-binding protein  49.23 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1491  3D domain protein  27.39 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5364  hypothetical protein  49.23 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5592  hypothetical protein  49.23 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165295 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5090  hypothetical protein  49.23 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4920  enterotoxin/cell wall-binding protein  49.23 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5481  hypothetical protein  49.23 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5033  3D domain-containing protein  49.23 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5330  hypothetical protein  49.23 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3987700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5412  hypothetical protein  49.23 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1015  fibronectin type III domain protein  46.67 
 
 
421 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000062719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1487  hypothetical protein  49.23 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000144613  hitchhiker  0.00534322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5360  hypothetical protein  49.23 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3562  hypothetical protein  49.23 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3845  hypothetical protein  49.23 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00016497  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2393  3D domain-containing protein  49.23 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0574  3D domain-containing protein  47.5 
 
 
416 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3773  3D domain-containing protein  49.23 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3481  3D domain-containing protein  49.23 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00402969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0596  hypothetical protein  46.34 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2199  aspartate protease family protein  44.32 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.312004  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0438  3D domain-containing protein  47.47 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0599  3D domain-containing protein  47.83 
 
 
431 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0752  hypothetical protein  47.83 
 
 
427 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0740  hypothetical protein  51.56 
 
 
424 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000128558 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0812  hypothetical protein  48 
 
 
427 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.791616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4620  hypothetical protein  48 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944224 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0716  hypothetical protein  47.83 
 
 
423 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.663265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0887  hypothetical protein  48.44 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0707  3D domain-containing protein  44.74 
 
 
478 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0849  enterotoxin  48.44 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4487  enterotoxin  48.44 
 
 
469 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113564 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0757  hypothetical protein  48.44 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0706  enterotoxin/cell wall-binding protein  48.44 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0692  enterotoxin/cell wall-binding protein  48.44 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0796  hypothetical protein  48.44 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4744  3D domain-containing protein  40.78 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0959  enterotoxin  48.44 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0891  enterotoxin  48.44 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46371e-34 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5061  hypothetical protein  38.83 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0573  3D domain protein  45.24 
 
 
260 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3025  3D domain protein  45 
 
 
212 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1049  3D domain protein  51.35 
 
 
145 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2880  3D domain protein  41.67 
 
 
236 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3534  3D domain-containing protein  39.78 
 
 
219 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4793  hypothetical protein  40.86 
 
 
219 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4654  hypothetical protein  40.86 
 
 
219 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5033  hypothetical protein  40.86 
 
 
219 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4634  hypothetical protein  40.86 
 
 
219 aa  59.3  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5067  hypothetical protein  40.86 
 
 
208 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5156  hypothetical protein  40.86 
 
 
208 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  28.36 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  28.36 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  28.36 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5062  3D domain protein  40.86 
 
 
206 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0180  hypothetical protein  40.21 
 
 
208 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  47.14 
 
 
1048 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>