More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0469 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0469  adenylate kinase  100 
 
 
224 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2028  adenylate kinase  69.64 
 
 
229 aa  324  7e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1683  adenylate kinase  68.3 
 
 
224 aa  318  5e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.196522  normal  0.133038 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0293  adenylate kinase  69.2 
 
 
223 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.229067 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1235  adenylate kinase  67.86 
 
 
229 aa  310  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0546768 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0784  adenylate kinase  66.96 
 
 
222 aa  306  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0235014  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1956  adenylate kinase  68.3 
 
 
223 aa  290  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  45.31 
 
 
211 aa  169  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  46.6 
 
 
217 aa  168  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  44.2 
 
 
214 aa  167  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  42.41 
 
 
213 aa  167  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  47.78 
 
 
213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  47.59 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  45.79 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  45.66 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  40.18 
 
 
214 aa  162  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  42.22 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  41.44 
 
 
214 aa  160  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  41.33 
 
 
217 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  42.51 
 
 
215 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  44.74 
 
 
216 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  44.74 
 
 
216 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  46.32 
 
 
217 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  45.55 
 
 
216 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  41.89 
 
 
219 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  43.5 
 
 
217 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  41.52 
 
 
218 aa  156  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  44.22 
 
 
217 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  41.07 
 
 
215 aa  154  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  41.52 
 
 
217 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  44.56 
 
 
217 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  44.44 
 
 
213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  45.05 
 
 
217 aa  151  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  41.03 
 
 
217 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  39.49 
 
 
214 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  37.05 
 
 
215 aa  149  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  36.16 
 
 
226 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  39.29 
 
 
214 aa  149  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  42.63 
 
 
215 aa  149  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3003  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  41.57 
 
 
222 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192004  hitchhiker  0.00720085 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  37.95 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2894  adenylate kinase  39.38 
 
 
214 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.290073  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  40.93 
 
 
208 aa  145  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3054  adenylate kinase  39.38 
 
 
214 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3194  adenylate kinase  39.38 
 
 
214 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.804867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  39.29 
 
 
216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  42.77 
 
 
216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09780  Adenylate kinase  39.29 
 
 
209 aa  145  5e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  36.61 
 
 
226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  38.05 
 
 
217 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  41.21 
 
 
189 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  38.42 
 
 
214 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  42.2 
 
 
216 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1088  adenylate kinase  37.78 
 
 
215 aa  142  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.670242  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  41.62 
 
 
216 aa  142  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  38.39 
 
 
217 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  38.95 
 
 
222 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  37.05 
 
 
217 aa  142  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  38.42 
 
 
217 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  38.39 
 
 
217 aa  141  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1504  adenylate kinase  41.41 
 
 
217 aa  142  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179397 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  36.16 
 
 
215 aa  141  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  36.16 
 
 
215 aa  141  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  40.46 
 
 
216 aa  141  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  40.46 
 
 
216 aa  141  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  40.46 
 
 
216 aa  141  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  40.46 
 
 
216 aa  141  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  40.46 
 
 
216 aa  141  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  41.04 
 
 
216 aa  141  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  41.04 
 
 
216 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  37.05 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  41.45 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  41.04 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0648  adenylate kinase  38.67 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0373092  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  37.05 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  38.18 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  40.45 
 
 
215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  37.89 
 
 
214 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  36.61 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23240  Adenylate kinase  38.64 
 
 
208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112414 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  40.84 
 
 
228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  37.5 
 
 
216 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3231  adenylate kinase  37.05 
 
 
214 aa  138  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00425  adenylate kinase  37.27 
 
 
214 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  37.27 
 
 
214 aa  138  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  37.27 
 
 
214 aa  138  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0513  adenylate kinase  37.27 
 
 
214 aa  138  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  37.27 
 
 
234 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  37.27 
 
 
214 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  37.27 
 
 
214 aa  138  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3142  adenylate kinase  37.27 
 
 
214 aa  138  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207455  normal  0.0239561 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  37.27 
 
 
214 aa  138  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0769  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  38.22 
 
 
215 aa  138  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.8085  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0648  adenylate kinase  39.19 
 
 
211 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  37.95 
 
 
214 aa  136  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  36.56 
 
 
216 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  37.37 
 
 
213 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0533  adenylate kinase  36.36 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0534  adenylate kinase  36.36 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0593  adenylate kinase  36.36 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>