52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0009 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0009  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  435  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.400013  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0102  hypothetical protein  50.23 
 
 
221 aa  168  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.210812 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0160  protein of unknown function DUF633  36.68 
 
 
234 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2411  protein of unknown function DUF633  34.36 
 
 
234 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00449661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4142  hypothetical protein  32.74 
 
 
235 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000128061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0496  hypothetical protein  37.9 
 
 
231 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000915457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4312  hypothetical protein  33.04 
 
 
235 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95415e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4192  hypothetical protein  32.29 
 
 
235 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00200706  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4030  hypothetical protein  32.29 
 
 
235 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000059354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4040  hypothetical protein  32.74 
 
 
235 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000619844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4513  hypothetical protein  32.29 
 
 
235 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000472419  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0625  hypothetical protein  39.05 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.155945  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0829  hypothetical protein  31.84 
 
 
235 aa  99  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000387788  hitchhiker  1.2637100000000002e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4370  hypothetical protein  31.84 
 
 
235 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00679884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4407  hypothetical protein  32.13 
 
 
235 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1228  hypothetical protein  30.14 
 
 
228 aa  98.2  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3017  hypothetical protein  32.16 
 
 
235 aa  96.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0496127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4424  hypothetical protein  31.39 
 
 
235 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1203  hypothetical protein  30.56 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1126  hypothetical protein  31.5 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000295652  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1975  protein of unknown function DUF633  35.37 
 
 
256 aa  92  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1111  SAM-dependent methyltransferase  32.93 
 
 
237 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0101071  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1973  hypothetical protein  29.1 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0572365  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2868  hypothetical protein  31.7 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.505053 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2262  hypothetical protein  28.57 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21581  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1173  SAM-dependent methyltransferase  30.58 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0722958  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2276  hypothetical protein  32.14 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699979  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3495  hypothetical protein  31.7 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.84074  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2390  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.351246  hitchhiker  0.000408238 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0746  hypothetical protein  31.53 
 
 
235 aa  86.3  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0893  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000579541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3035  protein of unknown function DUF633  36.62 
 
 
243 aa  85.5  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143624  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4779  hypothetical protein  35.58 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl271  putative SAM-dependent methyltransferase  28.48 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0014027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2433  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850819  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0502  hypothetical protein  24.35 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00991935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0543  protein of unknown function DUF633  27.72 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000632736  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4328  hypothetical protein  34.13 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1620  protein of unknown function DUF633  30.67 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.282895  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1652  hypothetical protein  30.18 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1618  hypothetical protein  30.18 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0130761  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2460  hypothetical protein  31.41 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4215  protein of unknown function DUF633  33.33 
 
 
265 aa  79  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  26.44 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0770  SAM-dependent methyltransferase  26.83 
 
 
229 aa  77  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3520  hypothetical protein  33.82 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  24.64 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0645  hypothetical protein  32.45 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000274924  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1216  protein of unknown function DUF633  27.48 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000079225  hitchhiker  0.00246839 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0357  hypothetical protein  28.12 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.298514  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1134  protein of unknown function DUF633  21.99 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000709417  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3883  O-methyltransferase family protein  28.7 
 
 
354 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.181684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>