213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4911 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0632  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.13 
 
 
505 aa  711  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.037982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4911  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
489 aa  1008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489735  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1046  nicotinate phosphoribosyltransferase  62.79 
 
 
489 aa  620  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3805  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.76 
 
 
491 aa  591  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3722  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.76 
 
 
491 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.790728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3664  nicotinate phosphoribosyltransferase related  57.76 
 
 
491 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.211664  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3666  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.04 
 
 
495 aa  568  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335827  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3792  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
491 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.94991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5746  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.3 
 
 
523 aa  502  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16160  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  51.25 
 
 
486 aa  493  1e-138  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.62808e-07 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1148  nicotinate phosphoribosyltransferase  50 
 
 
486 aa  483  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.24916  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09180  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  48.22 
 
 
489 aa  466  1e-130  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.346116 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0528  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.35 
 
 
498 aa  466  1e-130  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.633345  unclonable  4.75164e-08 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0797  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.75 
 
 
485 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1528  nicotinate phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 
490 aa  431  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2593  nicotinate phosphoribosyltransferase related  44.61 
 
 
458 aa  417  1e-115  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0996  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.17 
 
 
501 aa  417  1e-115  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0354541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2373  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.04 
 
 
476 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0112042  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0635  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.81 
 
 
487 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.821455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0513  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.08 
 
 
487 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2003  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.08 
 
 
489 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.675811  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1969  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.08 
 
 
489 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.411515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0511  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.76 
 
 
487 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0596  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
487 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0565  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
487 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3836  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.27 
 
 
485 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0322574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0509  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.25 
 
 
487 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0724  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.61 
 
 
487 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0664  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
487 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0653  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.25 
 
 
487 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7551e-11 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0507  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.25 
 
 
487 aa  411  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4703  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.61 
 
 
487 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101236 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1540  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.68 
 
 
480 aa  405  1e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.809941  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1450  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.24 
 
 
489 aa  402  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.532365  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0295  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.72 
 
 
486 aa  403  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2289  nicotinate phosphoribosyltransferase  45 
 
 
481 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2627  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.13 
 
 
489 aa  399  1e-110  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0273  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.13 
 
 
484 aa  399  1e-110  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0113  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  43.19 
 
 
476 aa  400  1e-110  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1177  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
486 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0494715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1758  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.14 
 
 
475 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0284  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.24 
 
 
488 aa  394  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2987  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.04 
 
 
479 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1538  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.97 
 
 
491 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2253  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.03 
 
 
484 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1202  nicotinate phosphoribosyltransferase  43 
 
 
490 aa  387  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1417  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.08 
 
 
490 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1964  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.19 
 
 
484 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0253491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1227  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.03 
 
 
490 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.507813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1071  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.04 
 
 
483 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.07171e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.24 
 
 
480 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.62 
 
 
477 aa  375  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0890  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
475 aa  370  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.71 
 
 
486 aa  365  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.914728  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0174  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.84 
 
 
478 aa  362  7e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.440374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1011  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 
468 aa  340  3e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.91 
 
 
468 aa  338  1e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0655  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.63 
 
 
481 aa  336  6e-91  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3381  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.47 
 
 
511 aa  331  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1946  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.64 
 
 
516 aa  328  2e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0457776  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0344  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.85 
 
 
467 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0322  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.64 
 
 
467 aa  322  9e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0100  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.38 
 
 
515 aa  320  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00987122  normal  0.985664 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39962  predicted protein  37.78 
 
 
558 aa  317  4e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0281  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.82 
 
 
456 aa  307  3e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.168647  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0255  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.03 
 
 
456 aa  306  7e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2602  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.63 
 
 
461 aa  303  6e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0227  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.32 
 
 
456 aa  303  6e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0827  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.99 
 
 
460 aa  299  7e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1180  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.02 
 
 
458 aa  299  9e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.690233  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.49 
 
 
462 aa  287  3e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46230  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.85 
 
 
452 aa  286  6e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4654  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.28 
 
 
453 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3577  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.28 
 
 
453 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  0.771098 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2057  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.79 
 
 
445 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134189  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1215  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
451 aa  281  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1212  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  40.51 
 
 
446 aa  275  9e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29887  predicted protein  35.26 
 
 
564 aa  274  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2760  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.18 
 
 
449 aa  273  6e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10583  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.26 
 
 
463 aa  272  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.127794  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2471  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.93 
 
 
451 aa  270  6e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0320218  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1780  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 
441 aa  268  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0195  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.16 
 
 
453 aa  266  9e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0939  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 
451 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0775  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 
451 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344543  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1009  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.21 
 
 
460 aa  265  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.948322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1985  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 
447 aa  264  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000236264  hitchhiker  0.00837081 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0763  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.17 
 
 
451 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2646  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.29 
 
 
450 aa  262  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159209  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0122  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.29 
 
 
465 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1116  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.27 
 
 
498 aa  257  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2236  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.58 
 
 
465 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.605686 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6179  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.29 
 
 
458 aa  256  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0625  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 
453 aa  255  1e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5927  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.78 
 
 
459 aa  255  2e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.19 
 
 
457 aa  251  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.275384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0293  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.61 
 
 
458 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3220  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.81 
 
 
458 aa  247  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0414  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
459 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0318  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.4 
 
 
459 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>