More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4874 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  219  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  91.96 
 
 		 112 aa  206  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  91.96 
 
 		 112 aa  206  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  90.18 
 
 		 112 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 		 112 aa  193  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1710  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 		 133 aa  190  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.619022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1738  nitrogen regulatory protein P-II  88.39 
 
 		 112 aa  186  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  183  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  78.57 
 
 		 112 aa  179  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2310  nitrogen regulatory protein P-II  85.71 
 
 		 112 aa  179  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  176  7e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2112  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1700  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  89.29 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260658  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 114 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  74.11 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 114 aa  169  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  75.89 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  75.89 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  76.99 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  76.11 
 
 		 114 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  77.36 
 
 		 136 aa  168  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  75.89 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 121 aa  167  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0979  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  166  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.594986 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  76.42 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  76.42 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  76.42 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  76.42 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  76.42 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  76.42 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  76.42 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  76.42 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  78.3 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  73.21 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  76.42 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0846  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>