19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1213 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1213  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  357  6e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00201716  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_996  hypothetical protein  81.08 
 
 
185 aa  300  1e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1023  hypothetical protein  79.46 
 
 
198 aa  296  2e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1030  hypothetical protein  30.97 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0049  protein of unknown function DUF95 transmembrane  36.51 
 
 
191 aa  58.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000020033  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1639  hypothetical protein  28.09 
 
 
193 aa  55.1  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0289  integral membrane protein  30.77 
 
 
246 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271645  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0527  hypothetical protein  25.82 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.917829  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1962  hypothetical protein  34.58 
 
 
197 aa  49.7  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.923141 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1138  hypothetical protein  30.11 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1427  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.25 
 
 
511 aa  49.3  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0532  hypothetical protein  26.44 
 
 
188 aa  48.1  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0209  hypothetical protein  30.1 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0691804  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0946  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.33 
 
 
188 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.886954  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0908  hypothetical protein  31.01 
 
 
196 aa  45.4  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  38.16 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0346  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.71 
 
 
528 aa  45.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.160239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.64 
 
 
509 aa  44.7  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0524  hypothetical protein  24.81 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.202307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>