46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0589 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0589  tubulin/FtsZ family protein  100 
 
 
392 aa  806    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000157682  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_529  GTPase domain, tubulin/FtsZ  100 
 
 
392 aa  806    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0564  tubulin/FtsZ, GTPase  98.72 
 
 
392 aa  801    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000265914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_922  FtsZ-like protein  54.5 
 
 
379 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585764  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0933  tubulin/FtsZ, GTPase  54.76 
 
 
379 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.013104  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1054  tubulin/FtsZ family protein  55.27 
 
 
379 aa  397  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0748006  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0639  Tubulin/FtsZ GTPase  31.98 
 
 
392 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2630  Tubulin/FtsZ GTPase  32.52 
 
 
392 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1412  Tubulin/FtsZ GTPase  31.52 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105348  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1300  Tubulin/FtsZ GTPase  31.44 
 
 
392 aa  142  7e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1892  Tubulin/FtsZ GTPase  32.96 
 
 
392 aa  135  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122904  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0004  Tubulin/FtsZ GTPase  30.6 
 
 
434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0345079  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0518  Tubulin/FtsZ GTPase  27.96 
 
 
388 aa  129  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0620842  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0726  tubulin/FtsZ, GTPase  29.12 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00716744  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1596  tubulin/FtsZ, GTPase  29.16 
 
 
393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.241888  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0522  Tubulin/FtsZ GTPase  29.25 
 
 
393 aa  126  9e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0695  tubulin/FtsZ, GTPase  29.26 
 
 
396 aa  123  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.954688  normal  0.243213 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1491  AIR synthase related protein  29.66 
 
 
397 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  normal  0.0235586 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1200  Tubulin/FtsZ GTPase  28.8 
 
 
359 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0390172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1348  Tubulin/FtsZ GTPase  29.09 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2614  Tubulin/FtsZ GTPase  27.7 
 
 
360 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3060  Tubulin/FtsZ GTPase  28.53 
 
 
358 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98064  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0198  Tubulin/FtsZ GTPase  28.76 
 
 
359 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.691776 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0239  tubulin/FtsZ, GTPase  26.95 
 
 
367 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1684  tubulin/FtsZ, GTPase  31.67 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0531719  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0527  cell division GTPase-like protein  23.65 
 
 
765 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.842807  normal  0.414486 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0556  cell division GTPase-like protein  24.68 
 
 
651 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0745283  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2673  Tubulin/FtsZ GTPase  25.26 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.662506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2258  cell division GTPase-like  24.45 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3616  Tubulin/FtsZ GTPase  24.03 
 
 
381 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0069  hypothetical protein  23.26 
 
 
648 aa  60.1  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000146951 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1688  Tubulin/FtsZ GTPase  22.5 
 
 
389 aa  56.6  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2283  Tubulin/FtsZ GTPase  27.64 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.781694  normal  0.248572 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0698  Tubulin/FtsZ GTPase  22.42 
 
 
384 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175752  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119480  gamma tubulin  23.67 
 
 
449 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.171432  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44225  predicted protein  24.41 
 
 
468 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.768572  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0660  cell division protein FtsZ  28.34 
 
 
362 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000000171768  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0964  cell division protein FtsZ  32.65 
 
 
370 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2517  cell division protein FtsZ  27.47 
 
 
420 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2172  cell division protein FtsZ  32.67 
 
 
513 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0335477  normal  0.0236284 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0894  cell division protein FtsZ  27.87 
 
 
422 aa  43.9  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00676  Tubulin gamma chain (Gamma-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P18695]  25.44 
 
 
454 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.372387  normal  0.509658 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0363  cell division protein FtsZ  23.8 
 
 
371 aa  43.9  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000281943  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2641  cell division protein FtsZ  32.2 
 
 
431 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.389094  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0747  cell division protein FtsZ  28.38 
 
 
360 aa  43.5  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.301526  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0743  cell division protein FtsZ  28.99 
 
 
385 aa  43.5  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0985135  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>