More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1071 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  100 
 
 
333 aa  680    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  72.05 
 
 
322 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  64.15 
 
 
328 aa  435  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2611  PhoH family protein  58.2 
 
 
351 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1272  PhoH family protein  56.57 
 
 
325 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  58.18 
 
 
348 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12600  PhoH family protein  57.19 
 
 
320 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2484  PhoH family protein  55.56 
 
 
320 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4280  PhoH family protein  57.42 
 
 
323 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3070  PhoH family protein  54.01 
 
 
324 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000842405 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0593  PhoH-like protein  56.79 
 
 
333 aa  363  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.318782  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0329  PhoH family protein  56.01 
 
 
316 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2048  PhoH family protein  55.05 
 
 
323 aa  355  6.999999999999999e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  54.26 
 
 
319 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  53 
 
 
319 aa  349  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  53 
 
 
319 aa  349  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  53 
 
 
319 aa  349  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  53 
 
 
319 aa  349  3e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  53 
 
 
319 aa  349  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  52.37 
 
 
319 aa  347  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  52.37 
 
 
319 aa  347  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  52.68 
 
 
319 aa  347  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  52.68 
 
 
319 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  52.68 
 
 
319 aa  346  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  53.18 
 
 
320 aa  345  8e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0134  PhoH family protein  54.11 
 
 
319 aa  342  5.999999999999999e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  54.07 
 
 
323 aa  342  8e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  54.82 
 
 
329 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  56.96 
 
 
331 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  53.5 
 
 
339 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  55.19 
 
 
340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1985  PhoH family protein  55.26 
 
 
323 aa  335  3.9999999999999995e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.460583  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  55.13 
 
 
334 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  54.87 
 
 
340 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1566  PhoH-like protein  53.95 
 
 
322 aa  335  9e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.359583  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3247  PhoH family protein  54.34 
 
 
348 aa  334  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0255  PhoH family protein  55.48 
 
 
328 aa  334  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  55.41 
 
 
341 aa  333  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  55.96 
 
 
332 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  54.6 
 
 
332 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  51.1 
 
 
326 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0480  phosphate starvation-induced protein  49.39 
 
 
353 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  55.96 
 
 
332 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1024  PhoH family protein  52.55 
 
 
320 aa  331  8e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  57.33 
 
 
350 aa  331  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  54.87 
 
 
315 aa  330  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2206  PhoH family protein  53.63 
 
 
333 aa  330  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  54.05 
 
 
359 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  55.96 
 
 
340 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3453  PhoH family protein  53.04 
 
 
380 aa  330  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.127019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  55.63 
 
 
332 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  55.96 
 
 
340 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  54.22 
 
 
315 aa  329  4e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  54.22 
 
 
315 aa  329  4e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0789  PhoH family protein  55.41 
 
 
333 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0567134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  54.46 
 
 
336 aa  328  7e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1507  PhoH family protein  48.48 
 
 
345 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048361  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1653  phoH family protein  51.2 
 
 
332 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1120  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  50 
 
 
319 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3832  PhoH family protein  52.9 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2706  PhoH family protein  53.95 
 
 
353 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12394  phoH-like protein phoH1 (phosphate starvation-inducible protein psiH)  53.97 
 
 
352 aa  325  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0707  PhoH family protein  52.6 
 
 
369 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3387  PhoH family protein  51.1 
 
 
375 aa  324  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1511  PhoH-like protein  52.79 
 
 
303 aa  323  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0777  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  47.87 
 
 
330 aa  323  2e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211004  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1912  PhoH family protein  52.96 
 
 
345 aa  323  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0986  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  47.59 
 
 
328 aa  322  5e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00869262  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0579  PhoH family protein  52.85 
 
 
318 aa  321  9.000000000000001e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.818814  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1969  PhoH family protein  50.47 
 
 
362 aa  321  9.000000000000001e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000703344 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1401  PhoH family protein  52.61 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.100499  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2303  PhoH family protein  48.75 
 
 
361 aa  320  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76142  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1285  PhoH family protein  52.61 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000129158  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0650  PhoH-like protein  54.57 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1267  PhoH-like protein  52.92 
 
 
345 aa  319  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2538  PhoH-like protein  49.52 
 
 
317 aa  320  3e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00160717  hitchhiker  0.00935106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1576  PhoH family protein  50.16 
 
 
355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0922563  normal  0.0310303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7049  PhoH family protein  50.15 
 
 
393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17250  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  49.69 
 
 
350 aa  318  6e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.465991  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  53.14 
 
 
348 aa  318  7e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0474  PhoH-like protein  53.09 
 
 
322 aa  317  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3467  PhoH family protein  50 
 
 
357 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3519  PhoH family protein  50 
 
 
357 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2905  PhoH family protein  48.65 
 
 
359 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.21329  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2813  PhoH family protein  48.65 
 
 
359 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4627  PhoH family protein  50.64 
 
 
344 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3456  PhoH-like protein  50 
 
 
319 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745001  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2038  PhoH family protein  50.16 
 
 
319 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2064  PhoH family protein  50.16 
 
 
319 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2112  PhoH family protein  52.96 
 
 
354 aa  316  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0986  PhoH family protein  53.9 
 
 
318 aa  315  5e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13580  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  51.68 
 
 
349 aa  316  5e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.340051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11730  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  50.16 
 
 
346 aa  315  7e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.332483  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4256  PhoH family protein  50.8 
 
 
323 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  53.05 
 
 
325 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00447  ATP-binding protein  52.37 
 
 
328 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000644199  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0844  phosphate starvation-inducible protein PhoH ATPase  51.29 
 
 
381 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0682  PhoH family protein  54.64 
 
 
323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  53.38 
 
 
338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3832  PhoH family protein  53.8 
 
 
351 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>