67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4340 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4340  KaiB domain protein  100 
 
 		 115 aa  230  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464711  decreased coverage  0.000276339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1883  KaiB domain protein  74.19 
 
 		 97 aa  152  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668658  normal  0.619396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2968  KaiB domain-containing protein  64.15 
 
 		 113 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.833946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4590  KaiB domain protein  69.23 
 
 		 115 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4477  KaiB domain protein  71.59 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4109  KaiB domain-containing protein  71.59 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.11763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1662  KaiB domain protein  68.09 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4009  KaiB domain-containing protein  68.09 
 
 		 97 aa  139  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6553  circadian clock protein  65.93 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1485  KaiB domain-containing protein  62.11 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.04601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1362  KaiB domain protein  64.37 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3121  KaiB domain protein  61.73 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.282526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3983  circadian clock KaiB-like protein  65.85 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2543  KaiB  58.24 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3312  hypothetical protein  64.63 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.967746  normal  0.156709 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1486  KaiB domain-containing protein  51.61 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0600  circadian clock protein KaiB  60 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3804  circadian clock protein KaiB  61.36 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573058  normal  0.0709765 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1661  KaiB domain protein  52.87 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1617  KaiB domain-containing protein  51.11 
 
 		 98 aa  104  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.155318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4232  circadian clock protein KaiB  60.23 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4294  circadian clock protein KaiB  60.23 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0347  circadian clock protein KaiB  60.23 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.891405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0008  KaiB domain protein  60 
 
 		 94 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5076  circadian clock protein KaiB  59.09 
 
 		 103 aa  103  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0742  KaiB  58.82 
 
 		 92 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1217  circadian clock protein KaiB  59.09 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15291  circadian clock protein KaiB  57.95 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15041  circadian clock protein KaiB  57.95 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.293704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1017  circadian clock protein KaiB  59.09 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15441  circadian clock protein KaiB  57.95 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.622562  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1441  circadian clock protein KaiB  56.82 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17701  circadian clock protein KaiB  55.68 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0105532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0548  circadian clock protein KaiB  54.55 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.346159  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0914  circadian clock protein KaiB  55.68 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13971  circadian clock protein KaiB  53.33 
 
 		 114 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2125  circadian clock protein KaiB  54.55 
 
 		 121 aa  98.2  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05431  circadian clock protein KaiB  53.33 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3358  KaiB domain-containing protein  53.49 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4149  KaiB domain-containing protein  53.49 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0589651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3005  KaiB domain protein  50 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.02 
 
 		 640 aa  94.4  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3933  KaiB domain protein  50 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2969  KaiB domain-containing protein  49.46 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3982  KaiB domain protein  50 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00133948  hitchhiker  0.00598629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4108  KaiB domain-containing protein  46.24 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.125834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1882  KaiB domain protein  40 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.980296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2227  KaiB domain-containing protein  52.33 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.923318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4357  circadian clock protein kaiB  49.41 
 
 		 107 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4589  KaiB domain protein  48.28 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4476  KaiB domain protein  50 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.386166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4010  KaiB domain-containing protein  44.09 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4339  KaiB domain protein  49.41 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42541  decreased coverage  0.000274688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1363  KaiB domain protein  49.41 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041708 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0014  KaiB domain-containing protein  44.19 
 
 		 251 aa  70.5  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3661  KaiB  43.59 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.535512  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1119  hypothetical protein  40.23 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4671  KaiB  37.5 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  0.131957 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1115  hypothetical protein  40.23 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0619  KaiB domain protein  41.86 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1544  KaiB domain protein  44.16 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5028  KaiB domain protein  43.59 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3323  KaiB domain protein  35.11 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2778  KaiB domain protein  35.11 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3294  KaiB  36.9 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6727  response regulator receiver protein  36.26 
 
 		 237 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3573  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 229 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>