17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3728 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3728  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  165  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1268  hypothetical protein  57.5 
 
 
81 aa  93.6  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.277803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0611  hypothetical protein  55 
 
 
100 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1090  hypothetical protein  56.25 
 
 
81 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.869282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1335  hypothetical protein  58.23 
 
 
84 aa  91.7  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000547457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3227  hypothetical protein  51.95 
 
 
79 aa  90.5  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000161134  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0742  hypothetical protein  52.56 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.568027  normal  0.756867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1110  hypothetical protein  52.56 
 
 
102 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.578339 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1149  hypothetical protein  46.84 
 
 
106 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3016  hypothetical protein  48.75 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.93406e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01280  hypothetical protein  51.28 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1637  hypothetical protein  43.04 
 
 
83 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2812  hypothetical protein  41.25 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111717  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1398  hypothetical protein  41.25 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957454 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0909  hypothetical protein  43.75 
 
 
81 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.593051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2789  hypothetical protein  41.67 
 
 
82 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.264247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0267  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  30.43 
 
 
1153 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.249441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>