16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3016 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3016  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  169  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.93406e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1335  hypothetical protein  53.42 
 
 		 84 aa  84  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000547457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1268  hypothetical protein  48.75 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.277803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1090  hypothetical protein  48.75 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.869282  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3728  hypothetical protein  48.75 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0742  hypothetical protein  48.65 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.568027  normal  0.756867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0909  hypothetical protein  48.1 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.593051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1398  hypothetical protein  45.68 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2812  hypothetical protein  43.59 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111717  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0611  hypothetical protein  42.11 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2789  hypothetical protein  43.84 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.264247  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1637  hypothetical protein  43.42 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310686 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1110  hypothetical protein  46.38 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.578339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3227  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000161134  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01280  hypothetical protein  39.19 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1149  hypothetical protein  41.33 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>